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Enregistrement W6998517629

Agent-Based Simulation of Nucleus Pulposus Cell Behavior in Alginate Hydrogels

2024· dissertation· en· W6998517629 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2024
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHydrogels: synthesis, properties, applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésNucleusSelf-healing hydrogelsCellCell nucleusCell culture
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction.Intervertebral disc (IVD) degeneration is a prevalent cause of back pain and disability, posing a significant socioeconomic burden.Current treatments often fail to stop the degenerative process or restore disc function.By varying calcium and alginate concentrations in hydrogels, biomaterial properties can be tuned to promote nucleus pulposus (NP) cell regeneration.Increased calcium crosslinking in hydrogels results in a stiffer matrix, directly affecting the synthesis of extracellular matrix (ECM) components such as aggrecan and collagen.Complementary to in vitro testing, computational modeling enables the optimization of biomaterial design and therapeutic strategies in a cost-effective and efficient manner.Agent-based modeling (ABM) proves particularly valuable in this context, where individual components interact with their environment according to programmed mathematical rules derived from literature.Governed by decision-making heuristics, ABM predicts emerging system properties from local interactions among autonomous entities.This structured approach facilitates detailed, high-throughput simulations of complex spatial-temporal systems, offering hypothesis-driven insights that are otherwise challenging to observe in traditional experimental settings.Research Goal.This thesis aimed to develop an alginate hydrogel ABM to numerically simulate NP cellular activity related to IVD regeneration over 21 days. Methods.In the intervertebral disc-hydrogel ABM (IVDH-ABM), NP cells were programmed to interact with each other and the environment through a set of

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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