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Enregistrement W6999056876

Biochemical and molecular characterization of the glycosomal PTS2 import receptor peroxin 7 in «Leishmania donovani»

2009· other· en· W6999056876 sur OpenAlexvenueno aff

Notice bibliographique

RevueLibrary and Archives Canada (Government of Canada) · 2009
Typeother
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiogenesisMicrobodyPeroxisomeDocking (animal)Macromolecular dockingEnzymePeptide sequenceOrganelle
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Leishmania peroxin 7 (LmPEX7 or LdPEX7) is the receptor that translocates PTS2 signal-containing proteins into the glycosome. This microbody is unique to and crucial for the survival of trypanosomatids which include Leishmania and Trypanosoma, the causative agents of leishmaniasis and African sleeping sickness, respectively. Proteins are imported into the glycosome via two pathways, PTS1 and PTS2, which involves the formation of a PTS-receptor complex in the cytosol, docking of the complex on a translocation apparatus on the glycosomal membrane, and subsequent release of the cargo protein into the lumen. However, the precise steps in glycosome protein trafficking are not well-defined and to understand the function of these organelles and prove their potential as chemotherapeutic targets, the mechanism of glycosome biogenesis needs to be fully elucidated. Not much is known about the mechanism of PTS2 import pathway in glycosomes as studies on PEX7 have been hampered by the difficulty in expressing a soluble recombinant form of this receptor. To dissect the PTS2 import pathway and to determine the role of PEX7 in Leishmania, this protein was cloned and characterized. LmPEX7 is a ~41 kDa protein containing six conserved WD40 motifs that displays limited sequence similarity to PEX7 homologues involved in the biogenesis of evolutionarily-related peroxisomes found in other eukaryotes. LmPEX7 interacts with PTS2 proteins, the PTS1 receptor LdPEX5, and the membrane-associated docking protein LdPEX14. These interactions, characterized through various biochemical techniques, were mediated by specific binding domains, formation of stable protein-protein complexes, and conform

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,136
Écart entre enseignants0,134 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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