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Enregistrement W6999180261

Characterization of loss of HLTF function in the development of colon cancer

2012· dissertation· en· W6999180261 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueMspace (University of Manitoba) · 2012
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKnockout mouseTranscription factorDNA damageMutantTumor suppressor geneTransgene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Helicase-like Transcription Factor (HLTF) is a DNA helicase protein which is homologous to SNF/SWI family. It has been demonstrated to be a functional homolog of yeast Rad5, required for the maintenance of genomic stability. Although the physiologic role of HLTF is largely unknown,inactivation of HLTF by promoter hypermethylation has been found in more than 40% human colon cancers. In this study, we have applied mouse transgenic approaches to determine whether loss of HLTF function could be important for colorectal carcinogenesis. HLTF knockout mice were generated by the deletion of first 5 exons of the HLTF gene. The complete loss of HLTF expression in HLTF -/- mice was confirmed by northern blot and real time RT-PCR assays. HLTF -/- mice did not show any developmental defects within a 2-year observation indicating that HLTF is dispensable for mouse development. Furthermore, HLTF -/- mice were free of intestinal or colorectal tumors or other types of tumors, suggesting that loss of HLTF function alone is not sufficient to drive oncogenic transformation in intestinal track and other tissues. To determine whether loss of HLTF function could cooperate with other tumor suppressors in the formation of colorectal cancers, we have bred HLTF knockout mice with the mutant mice for APC (adenomtous polyposis coli) and P53. In HLTF -/-APC Min/+ mice, a significantly increased formation of intestinal adenocarcinoma and colorectal cancers were observed. Although very few HLTF -/-P53 -/- mice developed colorectal cancers, these mice had increased incidence of the formation of metastatic lymphomas. Cytogenetic analysis of colorectal cancer cells derived from HLTF -/-APC Min/+ mice demonstrated a high incidence of gross chromosomal instabilities, including Robertsonian fusions, fragments and aneuploidy. All these genetic alterations were not observed in the intestinal tumor cells from APC Min/+, implicating that loss of HLTF function could induce genomic instability which contributes to intestinal carcinogenesis. To further investigate the role of HLTF in colorectal carcinogenesis, we have also applied a shRNA knockdown approach to down-regulate HLTF expression in human HCT-116 colon cancer cells. HCT-116 cells highly express HLTF and show less chromosomal instability, making these cells as a very useful model to investigate the loss of function of HLTF in human colorectal carcinogenesis. Using Western blot approach, we confirmed that HLTF knockdown HCT-116 cells had less than 5% of HLTF expression as compared to the scramble controls. By inoculating HLTF knockdown HCT-116 cells to Rag1 -/-IL2 -/- immunocompromised mice, we further demonstrated that HLTF knockdown promote tumor growth and invasion. Moreover, spectral karyotyping analysis revealed that HLTF knockdown human colon cancer cells had significantly increased chromosomal instability, including both aneuploidy and chromosomal translocation. Taken together, our work strongly indicates that loss of HLTF function can promote the malignant transformation of intestinal or colonic adenomas to carcinomas by inducing genomic instability. Given the high frequency of epigenetic inactivation by hypermethylation of HLTF in human colon cancers, our studies strongly suggest that this epigenetic alteration could be directly involved in the development of colorectal cancer rather than a consequence of this carcinogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,705
Score d'incertitude au seuil0,918

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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