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Enregistrement W7000707562

Genetic Regulation of Immune Responses in Holstein Dairy Cows across Canada

2012· dissertation· en· W7000707562 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueThe Atrium (University of Guelph) · 2012
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMilk Quality and Mastitis in Dairy Cows
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHerdHeritabilityMastitisImmune systemDairy cattleAntibodyIncidence (geometry)Genetic correlation
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diseases that affect dairy cattle have serious economic and animal welfare implications. The inclusion of immune response (IR) traits in breeding indices has been suggested to improve inherent animal health, and decrease the use of antimicrobials. The objectives of this research were to (1) evaluate cell-mediated (CMIR) and antibody-mediated immune responses (AMIR) on 680 Holstein cows from 58 herds across Canada, (2) estimate genetic parameters of these traits (3) examine the associations with routinely evaluated traits as well as the incidence of mastitis, (4) evaluate the correlation of natural and specific antibody and (5) perform a genome-wide association study (GWAS) to determine genetic markers associated with high or low IR. In collaboration with the Canadian Bovine Mastitis Research Network cows were immunized with both a type 1 and type 2 test antigen to stimulate CMIR and AMIR, respectively. A cutaneous delayed-type hypersensitivity test to the type 1 test antigen was used as an indicator of CMIR, and serum antibody (IgG1 and IgG2) to the type 2 test antigen as an indicator of AMIR. IR phenotypes varied significantly by cow, herd and region in Canada. Heritability estimates were moderate, 0.19 for CMIR and 0.16-0.43 for AMIR depending on time in the immunization protocol and antibody isotype. Beneficial associations between AMIR and some reproductive traits were found. Using estimated breeding values, cows were classified as high, average or low responders. High AMIR cows had significantly lower incidence rates of clinical mastitis compared to average and low cows. No difference was found when cows were classified based on CMIR. Natural antibody was not genetically correlated with specific antibody nor was it associated with mastitis. The GWAS found 198 genetic markers significantly associated with AMIR, with the majority on chromosome 23 where the major histocompatability complex is located. Other significant genes involved in IR include those associated with the complement system, interleukin 17 and tumor necrosis factor. This research confirms the benefit of identifying high IR cows and gives a glimpse of current IR profiles in Canadian Holsteins. This was the first GWAS for IR traits in dairy cattle and suggests it may be possible to include IR traits in genomic selection indices.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,976
Score d'incertitude au seuil0,963

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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