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Enregistrement W7000777114

GENETIC DIFFERENTIATION AND STRUCTURE OF BOREAL POPULATIONS OF CROSSOCALYX HELLERIANUS (NEES EX LINDENB.) MEYL. IN NORTH AMERICA

2020· other· en· W7000777114 sur OpenAlexfundaboutno aff

Notice bibliographique

RevueDepositum (Université du Québec en Abitibi-Témiscamingue) · 2020
Typeother
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Biodiversity Monitoring InstituteUniversité Laval
Mots-clésBiological dispersalGenetic structureGenetic diversityAsexual reproductionPopulationTaigaHabitatBryophyte
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Studying population genetic parameters of dominantly asexual bryophyte species is interesting due to the unique features of their life cycle, such as a relatively short distance dispersal capacity and a lack of the advantages of sexual reproduction. Studying asexual species becomes even more interesting when the study species are also habitat specialists, are rare in part of their global distribution, and have a dominant haploid life cycle. We chose a species that falls into all the above categories, Crossocalyx hellerianus (Nees ex Lindenb.) Meyl.; a minute dioicous epixylic liverwort with dominant asexual reproduction, which inhabits decaying logs and stumps of coniferous trees in boreal and subalpine forests with a circumboreal- subcontinental distribution. The objective of this study is to identify the spatial pattern of genetic variation and structure of C. hellerianus from population (site) to regional (100 km) and intercontinental scales (10 000 km) and to subsequently answer the question, how do the current distribution of the species and dispersal limitations shape the spatial genetic patterns of C. hellerianus? \n \nSamples were collected from three provinces in Canada: Quebec (15 populations, 104 individuals), Alberta (six populations, 50 individuals), and New Brunswick (one population, nine individuals). Using already published data, we compared Canadian and European populations with six populations (99 individuals) from the Czech Republic and four populations (241 individuals) from Finland. Six polymorphic microsatellite markers were used to genotype the individuals. The sequenced data were analyzed for genetic diversity estimations, genetic variation, and population structure parameters using different software packages. \n \nDespite the dominant asexual reproduction mode of this species, we observed a high level of genetic diversity even within colony and population levels. Also, we found some evidence of long-distance dispersal of asexual propagules of the species. In terms of genetic variation and structure, we observed two main clusters in North America and few barriers to gene flow, which is a pattern similar to that found in boreal tree species in North America that were influenced by post-glacial dispersal patterns. The populations from the Gulf of St-Lawrence region were differentiated from the other populations. At the intercontinental level, three significant clusters were observed as Canadian, Czech, and Finnish populations each formed a cluster, although a connection between Europe and North America is suggested via the Gulf of St-Lawrence region. \n \nThe results of this research indicate that the populations of asexually reproducing species can be as genetically diverse as sexually reproducing species. Furthermore, the genetic structure of the species in North America has been shaped by post-glacial dispersal patterns and biogeographic connections between North American and Europe.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,825
Score d'incertitude au seuil0,352

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,181
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
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