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Enregistrement W7000940790

Identification and functional characterization of acyl-CoA:lysocardiolipin acyltransferase 2 (ALCAT2)

2014· dissertation· en· W7000940790 sur OpenAlexvenueno aff

Notice bibliographique

RevueLibrary and Archives Canada (Government of Canada) · 2014
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAcyltransferaseGene isoformAcyltransferasesGlycerophospholipidsCardiolipinEnzymeLysophosphatidic acidPhosphatidylinositolFatty acidSynaptotagmin 1
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human genome project has allowed for the rapid identification of a large number of protein families based on similarities in their genetic sequences. The acyl-glycerol phosphate acyltransferase (AGPAT) family of enzymes have been largely identified through sequence homology, with eleven isoforms identified in both mice and humans. Interestingly, very little work has been done on the characterization of AGPAT isoform 4. In the present study, I report the functional characterization of AGPAT4 as an acyl-CoA: lysocardiolipin acyltransferase (ALCAT), which we have renamed ALCAT2. Although ALCAT2 is present in most tissues, it is abundant in multiple brain regions including olfactory bulbs, hippocampus, cerebellum, cortex, and brain stem, and is detectable in both primary neurons and glial cells. In assays performed in vitro, ALCAT2 significantly increased the incorporation of [14C]oleoyl-CoA into phosphatidylinositol and CL using either lysophosphatidylinositol, or monolysocardiolipin or dilysocardiolipin as acyl acceptors, respectively. ALCAT2 did not display significant acyltransferase activity with lysophosphatidic acid, lysophosphatidylcholine, lysophosphatidylethanolamine, lysophosphatidylserine, or lysophosphatidylglycerol acyl acceptors. Overexpressing ALCAT2 in HEK-293 cells increased the total CL content, but did not significantly affect levels of other glycerophospholipids including phosphatidylinositol. Analysis of the fatty acyl profile of CL from ALCAT2-overexpressing cells indicated increased total saturated fatty acids, particularly stearate, palmitate, and myristate, and increased levels of n-3 polyunsaturated fatty acids α-linolenic acid (18:3n-3), eicosatrienoic acid (20:3n-3), and eicosapentanoic acid (20:5n-3). In accordance with its observed role in cardiolipin remodeling, ALCAT2 localized predominately to the mitochondria. ALCAT2 was also \nregulated during embryogenesis, and in varying metabolic states. In summary, ALCAT2 is a new enzyme in CL remodeling with a potential role in mitochondrial function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,141
Écart entre enseignants0,139 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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