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Enregistrement W7001320619

Investigating transcriptional control of MECP2-BDNF-miR-132 homeostasis network; implicating the role of MeCP2E1/E2 overexpression and metabolic drugs

2021· dissertation· en· W7001320619 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueMspace (University of Manitoba) · 2021
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMECP2Rett syndromeTranscriptional regulationEpigeneticsGene isoformRegulatorNucleolinRepressorRegulation of gene expressionmicroRNA
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rett Syndrome (RTT) and MECP2 Duplication Syndrome (MDS) are caused by mutations in the MECP2 gene encoding “methyl CpG binding protein 2” (MeCP2), a critical epigenetic regulator in the brain. There is no cure available for these diseases, but symptoms have been reversed in mouse models. The two isoforms of the protein, MeCP2E1 and E2 are differentially expressed in the brain and there is increasing evidence that they have unique functions, which is important to consider in developing therapeutic strategies for MeCP2-related disorders. MeCP2 has been shown to function as a transcriptional activator and repressor but the role of each isoform in transcriptional regulation has not been extensively studied. In this study, a new gain-of-function model of MeCP2 isoform-specific overexpression was generated in human brain cells through stable lentiviral transduction. Nascent RNA analysis was performed to test the transcriptional effects of the two isoforms on selected target genes, BDNF and miR-132, which form a homeostasis network with MeCP2, as well as Nucleolin and ribosomal RNAs. Both isoforms were shown to increase nascent BDNF transcripts. The results of the human brain cell line correspond with previous observations in human RTT brain tissues, indicating the model established here could be used in the future for additional screening studies. Small molecule drug screening for RTT therapies has recently focused on metabolic drugs which have the potential to correct metabolic defects in RTT patients as well as cognitive defects. The impact of these drugs on MeCP2 regulation is an important aspect of these studies, since MeCP2 levels are tightly controlled. In this study, the effect of simvastatin and metformin on MECP2 and BDNF transcription was assessed in human brain cells. The results suggested that metformin controls MECP2E1 and BDNF post-transcriptionally, but the effect on MECP2E2 is transcriptional and is a promising drug for RTT. This study highlights the importance of isoform-specific analysis in studies of MeCP2 function and analysis of potential RTT therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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