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Enregistrement W7002181823

Mouse chemical mutagenesis to identify new immune mechanisms against cytomegalovirus and herpes simplex virus 1

2018· dissertation· en· W7002181823 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2018
Typedissertation
Langueen
DomaineEconomics, Econometrics and Finance
ThématiqueDiverse Scientific and Economic Studies
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill Genome Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHerpes simplex virusMutagenesisVirusHuman cytomegalovirusMutationImmune systemCD8GeneCytotoxic T cell
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Herpes simplex virus 1 (HSV-1) and cytomegalovirus (CMV) are ubiquitous and very prevalent pathogens.Infections with these agents result in a variety of clinical syndromes, ranging from asymptomatic to severe infection, with high mortality rates and significant long-term morbidity, particularly in vulnerable in immunocompromised or immature populations.The use of inbred mouse strains that accurately replicate disease and exhibit natural genetic variation in susceptibility has been particularly useful to understand fundamental mechanisms of virus disease pathogenesis.Further, random chemical mutagenesis with N-Ethyl-N-Nitrosourea (ENU) is a powerful tool to identify new mutations on genes and pathways critical to immunity.We have developed an ENU mutagenesis platform followed by a high-throughput infection pipeline allowing us to screen a high number of mice for susceptibility to either CMV or to HSV-1 infection.We generated and tested more than 264 pedigrees, for a total of 4200 animals for gained susceptibility to infection.Doing so, we found 6 families exhibiting susceptibility to HSV-1 and 1 to CMV.We selected one pedigree susceptible to HSV-1 for further analysis.We found a non-synonymous mutation in the linker domain (LD) of STAT5A (W484G).CD8+ T cells and NK cell responses were affected in STAT5A W484G mice, as their numbers were reduced following infection with HSV-1, as were the antigen experienced CD44+ CD8+ T cells.After stimulation with IL-2, which is mediated in part by STAT5A, NK cells did not increase the expression of IL-2Rβ as much as wild type mice, while the expression of IL-2Rα on CD4 and CD8 T cells was abrogated.These results show that STAT5A is important to the T cell and NK cell immune responses to HSV-1 and CMV infection and a single point mutation in its LD is sufficient to compromise STAT5A function.We also analysed a pedigree susceptible to CMV and identified a critical mutation on the uncharacterized GTPase GNL1.NK cells, which play a non-redundant role in CMV resistance, were drastically reduced in mutant animals, causing viral susceptibility.NK cells also exhibited an increase in caspase 3 activity accompanied with a dysfunctional cell cycle progression after IL2 and IL15 stimulation, two cytokines critical for NK cell GNL1 deficiency affects the integrity of the main immune organs ...................................The absence of GNL1 leads to a NK deficiency .......

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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