Phylogeny and historical biogeography of the Neotropical palm tribe Euterpeae (Arecaceae)
Notice bibliographique
Résumé
Tribe Euterpeae is a group of Neotropical palms that comprises 33 species in 5 genera distributed from Central America to Southeastern Brazil and Bolivia, including the Caribbean islands. Some species are important elements of Amazonian forests since they can be among the 10 most abundant trees. Some members of this tribe are economically important for their oil production and edible palm heart. In this study I aimed to clarify the intergeneric and interspecific relationships within Euterpeae and estimate the time and place of origin of its taxa. I also tested for changes in inflorescence types in the tribe. I reconstructed a phylogenetic tree with maximum likelihood and a dated Bayesian phylogenetic tree using one plastid (trnD-trnT) and four low-copy nuclear DNA regions (CISP4, WRKY6, RPB2, and PHYB). I used five fossil and two secondary calibration points to estimate divergence times. I amplified sequences from 27 Euterpeae species including 7 infra-specific taxa and 41 outgroup taxa. The tribe and each genus were monophyletic with high support. Hyospathe was sister to the rest of the genera. Euterpe was sister to Neonicholsonia and Prestoea was sister to Oenocarpus. The ancestral inflorescence type of Euterpeae is likely one with rachillae all around the main axis from which the hippuriform (horsetail shape) inflorescence of Oenocarpus originated. Some widely distributed species with infra-specific taxa (Euterpe precatoria, Prestoea acuminata and Hyospathe elegans) were not monophyletic, which invites a revision of these species circumscriptions. The Euterpeae diverged from its sister clade Areceae at around 46 million years ago (Mya), while the crown age of the Euterpeae was estimated at around 40 Mya. Although Euterpeae’s origin occurred in the Eocene most of the extant genera had crown ages after the middle Miocene (<17 Mya) with some species originating later during the Pliocene to Pleistocene. This work represents the most complete molecular phylogeny of the group, and inclusion of the few missing narrow endemic taxa will provide a more complete understanding of the interspecific relationships of the tribe.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».