Population-specific transcriptional plasticity and sub-lethal thermal thresholds in developing lake sturgeon, Acipenser fulvescens
Notice bibliographique
Résumé
Changing temperatures elevate threats to physiological function in endangered freshwater species such as the lake sturgeon, Acipenser fulvescens, especially throughout vulnerable periods of early development. If temperatures breach sub-lethal thresholds, transcriptomic plasticity and acclimation capacity and a reduction of protein level responses may be diminished, increasing the vulnerability of lake sturgeon to additional environmental stressors. My thesis research investigated the effects of changing temperatures on the physiology of developing lake sturgeon from Manitoba, Canada. A common garden strategy was employed, where lake sturgeon from northern and southern populations within Manitoba were reared at equivalent and environmentally-relevant temperatures. Lake sturgeon demonstrated acclimation-specific effects on thermal tolerance related phenotypes including morphology, metabolic rate, critical thermal maximum, transcriptional responses, mortality and transcriptional responses to cold stress later in life with relative performance in many traits declining as acclimatory temperatures increased. Many of the above phenotypic responses were population-specific, with lower thermal maxima and sub-lethal thermal thresholds in the northern population of lake sturgeon. Next, I used mRNA sequencing of gill tissue and found enhanced transcriptional plasticity in the southern population relative to the less thermally tolerant northern counterparts. Pathway-specific functional analysis implicated mitochondrial function, oxidative damage, and immunocompetence as key mechanisms modulated by increasing acclimation temperatures with functional analysis indicating additional population-specific biological processes. Last, we specifically investigated the effects of sub-lethal thermal thresholds on stress and innate immune capacity through transcriptional profiling using qPCR. Acclimation temperature influenced the endocrine stress response and impaired the activation of molecular pathways involved in the immune, stress, and fatty acid responses of pathogen-challenged lake sturgeon in early development. Collective results suggest that, as environmental temperatures intensify, transcriptional plasticity, sub-lethal thermal tolerance thresholds, and overall physiological plasticity are diminished, likely resulting in the increased susceptibility of developing lake sturgeon to the effects of compounding environmental stressors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».