Role of residues on the proximal side of the heme in catalase HPII of Escherichia coli
Notice bibliographique
Résumé
Through site-directed mutagenesism the roles of the amino acids H392, H395, D197, Q419 in heme conversion were studied. H392 mutants which disable the His-Tyr bond contain only heme b as their prosthetic group, and lose specific activity, thermostability and sensitivity to the inhibitors NaCN, NaN3, NH2OH, CH3ONH2, C2 H5ONH2 compared to wild type HPII. Populations of D197S/H395Q and 0419A mutant HPII contain both heme b and heme d as their prosthetic group, and are less thermostable compared to wild type HPII but retain wild type HPII characteristics regarding enzyme kinetics and inhibitor sensitivity. H395A, H395Q, D 97A, D197S and Q419H mutants showed no significant differences when compared to wild type HPII. It therefore appears that, while His392, His395, Asp 197 and Gln419 are all involved in heme conversion, only the presence of His392 is absolutely critical for the reaction to proceed. These results support the mechanistic relationship between the proposed autocatalytic conversion of heme b to heme d mechanism proposed by Bravo 'et al'. (1997a). (Abstract shortened by UMI.)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».