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Enregistrement W7005958473

Role of histone methylation in the regulation of tumour suppressor networks

2016· dissertation· en· W7005958473 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2016
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLepidoptera: Biology and Taxonomy
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchTerry Fox Foundation
Mots-clésHistoneSuppressorDNA methylationEpigeneticsMethylationHistone H2A
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cellular senescence is a tumour suppressor mechanism which prevents the proliferation of malignant cells.In normal cells, oncogenic stimuli induce a senescence response and growth arrest coordinated by tumour suppressor genes, but the loss of expression of these genes impairs the establishment of senescence in cancer cells.We studied the role of histone methylation and oncogenic histone modifiers to assess their responsibility throughout the bypass of tumour suppressor pathways.We first used a PRMT6 knock-out mouse model to recognize the potential effect of PRMT6mediated histone arginine methylation in cancer.Herein, we report that PRMT6 catalyzes the asymmetric di-methylation of histone H3 at arginine R2 (H3R2me2a) inside the promoter region of the Trp53 gene, resulting in the transcriptional repression of p53.In mice, functional inactivation of p53 is sufficient to bypass oncogene-induced senescence (OIS).We demonstrated that the overexpression of PRMT6 cooperates with oncogenic Ras in the bypass of OIS, suggesting an important role for histone arginine methylation mediated by PRMT6 in promoting tumourigenesis.In the second part of my thesis, I describe miR-137 as an inhibitor of KDM4A expression.KDM4A is a histone lysine demethylase participating in gene repression and the bypass of OIS to promote tumourigenesis in vivo.Specifically, KDM4A targets CHD5, a tumour suppressor and positive regulator p53 expression.We observed that miR-137 expression is lost in Ras-dependent pancreatic cancer.Moreover, restoration of its expression led to cellular growth arrest and senescence in pancreatic cancer cells.We used short hairpin inhibitors of p53 and p16 INK4A to dissect the senescence pathways controlled by miR-137 and noticed that both ARF/p53 and p16 INK4A /pRb tumour suppressor pathways were independently induced by miR-137.Importantly, expression of miR-137 is enhanced upon Ras activation, and the inhibition of miR-137 activity led to the bypass of OIS.These results suggest that miR-137 targets KDM4A to mediate senescence in response to oncogenic Ras, and that silencing of miR-137 could promote the Ras-driven transformation of pancreatic cancer cells.The work presented in this thesis emphasizes on the importance of the senescence response in tumour suppression.Our results provide a connection between deregulated histone methylation and defective OIS signaling in cancer.I propose that modulating the enzymes responsible for the repression of tumour suppressor genes could be a promising avenue in the prevention or treatment of cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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