Antigenicity of the norovirus capsid
Notice bibliographique
Résumé
The purpose of this study was to produce monoclonal antibodies against prevalent genogroup I (GI) and genogroup II (GII) noroviruses. Monoclonal antibody CM45 was raised to the Leeds capsid protein (GIId) and cross-reacted with GIIb, GIIc and GIId noroviruses. Monoclonal antibody CM55 was raised to the Toronto virus capsid protein (GIIa) and was specific for GIIa noroviruses. These monoclonal antibodies were incorporated into Enzyme Linked Immunosorbent Assays (ELISAs) for the detection of GII noroviruses in clinical specimens and in the future will be used in epidemiological studies. Monoclonal antibody CM54 was raised to the Southampton virus (SV) capsid protein (GIa) and cross-reacted with GI capsid proteins. To characterise the monoclonal antibody binding site a series of truncated forms of the SV capsid protein were expressed as fusions to GST in E. coli. Immunoblot analysis indicated the monoclonal antibody binding site was located between amino acid residues 102-255 of the SV capsid protein. The epitope recognised by monoclonal antibody CM54 was mapped using a peptide array. Monoclonal antibody CM54 bound to the sequence LEDVRN. Alignment of norovirus capsid protein sequences illustrated the epitope (LEDVRN) was common to GI capsid proteins, but not present in GII capsid proteins. Interestingly this epitope was also present in GIIIb capsid protein sequences. Monoclonal antibody CM54 reacted by ELISA and immunoblot to NA-2 (GIIIb) VLPs. The epitope recognised by monoclonal antibody CM39 was also deduced. Monoclonal antibody CM39 reacts to Jena virus (JV), a bovine norovirus (GIIIa). Monoclonal antibody CM39 bound to the pentapeptide sequence PTAGA, which is common to the genogroup III (GIII) noroviruses. Interestingly, both of these epitopes are present in the shell domain of the capsid protein. This work described the precise molecular recognition sequence of two monoclonal antibodies and the binding sites were mapped on the published three dimensional structure of the norovirus capsid protein.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».