Chromosome territory position of chromosome X and 11 is non-random and cell-type specific in mouse cells of B cell lineage
Notice bibliographique
Résumé
The interphase nucleus of a cell is organized into non-random, cell-type specific chromosome territolies (CTs). In lymphocytes, a gene-density correlated radial arrangement has been identified, with gene-dense CTs located more in the nuclear interior and gene-poor CTs located towards the periphery. However, other factors such as chromosome size, transcription and interactions of the nuclear membrane and matrix are also involved in the final ammgement of CTs within a nucleus. In this project, the CTs of chromosome 11 and X were studied in five different cell types of mouse B cell lineage: diploid preB cells, primary B cells of [T38HxBALB/c]N wild-type mice, primary B cells of [T38HxBALB/c]N with rcpT(X;l1) mice, primary B cells of BALB/c mice and a Wehi 231 mouse B lymphoma line. These two chromosomes have not been studied before in the mouse. 3D FISH experiments that labeled the CTs of chromosome 11 and X with chromosome-specific paints were carried out for each cell type. The karyotype regarding these two chromosomes and specificity of the chromosome paints was first confim1ed through 2D FISH experiments. The radial distance from the centre of each CT to the centre of the nucleus was measured lIsing AxioVision 4.8 software. The results show a non-random, statistically significant and cell-type specific nuclear distribution of these two chromosomes. Altered nuclear positions of translocation chromosomes in normal healthy mice and as a result of tumorigenesis were observed in the primary B cells of [T38HxBALB/c]N with rcpT(X;l1) mice and in the Wehi 231 mouse B lymphoma line, respectively.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».