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Enregistrement W7008978748

Development and Validation of a Human Blood Acyl-Specific Lipidomic Profiling Method for Clinical Applications

2015· dissertation· en· W7008978748 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueUWSpace (University of Waterloo) · 2015
Typedissertation
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueFatty Acid Research and Health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversities Space Research Association
Mots-clésEicosapentaenoic acidDocosahexaenoic acidLipidomicsFatty acidFish oilWhole bloodBlood lipidsDerivatizationPolyunsaturated fatty acidHuman blood
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Blood fatty acid levels have been used to determine dietary intakes of omega-3 highly unsaturated fatty acids, but also to examine the link between blood fatty acids, health and disease. However, these lipid analyses are gas chromatography-based and are dependent on derivatization of lipids to fatty acid methyl esters and do not provide information about the fatty acyl parent lipid species. The use of ultra high-performance liquid chromatography combined with tandem mass spectrometry (UHPLC-MS/MS) has the potential to do so. This thesis adapted a lipidomic approach to traditional blood fatty acid profiling to characterize lipids in their naturally-occurring state in human blood. Semi-quantitative methods using UHPLC-MS/MS were developed using a high-resolution Quadrupole-Orbitrap Hybrid Mass Spectrometer (Thermo Q-Exactive), and were validated for the determination of lipids in whole blood. Molecular species were confirmed for over 500 lipids, including phospholipids, sphingolipids, triacylglycerols, cholesteryl esters, free cholesterol and free fatty acids. Over 150 acyl-specific species were confirmed from all lipid classes. Following this, the method was used to validate dried blood spots for lipidomic profiling as this sampling technique offers several advantages, including minimally invasive sample collection, stability, and facilitated handling. Additionally, the UHPLC-MS/MS method was used to examine whole blood lipid remodeling that follows fish oil supplementation. Specifically, the blood lipidomic profiles of samples from a previous intervention trial comprising 20 participants that received eicosapentaenoic acid + docosahexaenoic acid (EPA+DHA) at 150 mg/d, 500 mg/d, and 1000 mg/d over a twelve-week period were determined. Notably, lipidomic profiling of whole blood suggests that three specific lipids (16:0/DHA phosphatidylcholine, 16:0/EPA phosphatidylcholine, and plasmenyl-phosphatidylethanolamine P-16:0/EPA) increase in a dose-dependent manner with increasing doses of EPA+DHA supplementation. Finally, lipidomic analyses of whole blood, plasma, and erythrocytes of individuals that consumed low, intermediate, and high amounts of EPA+DHA were performed. These results support previous observations on the rapid responsiveness of 16:0/DHA phosphatidylcholine and 16:0/EPA phosphatidylcholine to varying levels of EPA+DHA intake. The mechanisms through which lipid remodeling occurs remain to be elucidated. The work presented in this thesis provides the foundation for the use of acyl-specific complex lipids as biomarkers for omega-3 highly unsaturated fatty acid status and the lipidomic profiling method developed may be extrapolated for the characterization of acyl-specific lipids in other biological matrices.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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