Evolution and determination of phenotype in salmonid fishes: Inferences from molecular markers in the absence of pedigree
Notice bibliographique
Résumé
Molecular markers can be used to scrutinize both pedigree and population genetic structure, providing important insights into phenotypic evolution and determination in natural populations. Here, microsatellite markers were used to investigate the determination of size, growth, and maturation traits in salmonid fishes. Two marker-assisted methodologies for estimating quantitative genetic parameters were compared in an aquaculture population of rainbow trout ('Oncorhynchus mykiss'). A regression-based model employing estimates of pairwise relatedness effectively detected significant components of genetic variance and covariance for size and spawning time traits. However, numerical estimates of parameters were unreliable. A Markov Chain Monte Carlo (MCMC) procedure to reconstruct families resulted in estimates that did not differ significantly from those obtained with known pedigree, and was therefore deemed the superior method. This method was then used to investigate constraints on the evolution of larger body size in two stunted populations (designated Lower and Upper) of brook charr ('Salvelinus fontinalis') from Freshwater River, Cape Race, Newfoundland, Canada. Population structure of the system was investigated using ecological and genetic methods. Over a 5-year period, mark-recapture data revealed limited movement, with the proportion of recaptured fish migrating from one population area to another being low (0-3.8%). Despite this, microsatellite analysis based on sixteen polymorphic loci provided no evidence of genetic differentiation. These results indicate that while gene flow occurs between the populations, they are relatively isolated on an ecological time frame. Selective and genetic constraints on the evolution of larger body size were investigated by measuring viability selection acting on length-at-age traits, and by estimating quantitative genetic parameters 'in situ' (following reconstruction of sibships using the MCMC procedure). In the Lower population, significant heritabilities were found for several traits, while selection was found to act on length-at-age traits in both populations. However selection does not in general favor larger adult size, and while such size selective mortality does operate on juveniles there is no evidence for a significant heritability of juvenile size in either population. Thus within each population, selection differentials and estimates of heritabilities for length-at-age traits, suggest that evolution of larger size is prevented by both selective and genetic constraints.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».