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Enregistrement W7010047019

Expression, regulation and function of the stem-loop binding protein during mammalian oogenesis

2005· dissertation· en· W7010047019 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2005
Typedissertation
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnergy and Environment Impacts
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthMcGill University
Mots-clésPolyadenylationHistoneOocyteTranslation (biology)Messenger RNARNA-binding proteinHistone H2ARNAProtein biosynthesis
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although mRNAs encoding the histone proteins are among the most abundant mRNAs in mammalian oocytes, the mechanism regulating their translation in these cells has not been identified. Most histone mRNAs are not polyadenylated but instead carry in their 3'-utr a highly conserved stem-loop structure. In somatic cells, the stem-loop binding protein (SLBP) is expressed during S-phase of the cell cycle and associates with the stem-loop of histone mRNAs promoting their processing and translation and thereby coordinating their expression to DNA replication. As histone mRNAs are abundant in immature oocytes which are in G2 of the cell cycle and in ovulated or mature oocytes which are in M-phase, I examined the expression and the regulation of histone mRNAs in immature and maturing mouse oocytes. First, I described SLBP expression during oogenesis and pre-implantation embryonic development. I showed that SLBP is present at low levels in the nucleus of the immature oocyte and accumulates significantly during maturation of the oocyte. At both stages, SLBP is the only stem-loop binding activity present. I showed that SLBP meiotic accumulation correlates with the adenylation of SLBP mRNA and is mediated by the presence of a cytoplasmic polyadenylation element in SLBP 3'-utr. Also, I demonstrated that histones are synthesized in the immature and mature oocyte and that the translation of a reporter mRNA bearing the histone 3'-utr increases dramatically during oocyte maturation consistent with the accumulation of SLBP. I specifically blocked SLBP accumulation using RNA interference and observed that both translation of the reporter mRNA and endogenous histone synthesis are significantly reduced. Moreover, SLBP-depleted eggs display a significant decrease in pronuclear size and in the total amount of histones detectable on their chromatin. Finally, I also showed that elevating the amount of SLBP in immature (G2) oocytes is sufficient to increase translatio

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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