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Enregistrement W7010347905

Identification of hemin- and hemoglobin-binding proteins of Actinobacillus pleuropneumoniae serotype

2003· article· en· W7010347905 sur OpenAlexvenueno aff

Notice bibliographique

RevueNPARC · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésActinobacillus pleuropneumoniaeSerotypeStrain (injury)Bacterial outer membraneActinobacillusPasteurellaceaeSignal peptide
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The reference strains representing serotypes 1 to 12 of Actinobacillus pleuropneumoniae biotype 1 were examined for their ability to utilize porcine hemoglobin (Hb) or porcine hemin (Hm) as iron sources for growth. In a growth promotion assay, all of the reference strains were able to use porcine Hb, and all strains except 2 were able to use porcine Hm. Using a preliminary characterization procedure with Hm- or Hb-agarose, Hm- and Hb-binding outer membrane proteins (OMPs) of approximately 75 kDa were isolated from A. pleuropneumoniae serotype 1 strain 4074 grown under iron-restricted conditions. Matrix-assisted laser desorption ionization/time-of-flight (MALDI-TOF) analysis revealed a number of common tryptic peptides between the Hb-agarose- and Hm-agarose-purified 75 kDa OMPs, strongly suggesting that these peptides originate from the same protein. A database search of these peptide sequences revealed identities with proteins from various Gram-negative bacteria, including iron-regulated OMPs, transporter proteins, as well as TonB-dependent receptors. Taken together, our data suggest that A. pleuropneumoniae synthesizes potential Hm- and Hb-binding proteins that could be implicated in the iron uptake from porcine Hb and Hm.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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