An Investigation into the Impact of Culture Method on Biofilm Recalcitrance from the Perspective of Chronic Ischemic Wounds
Notice bibliographique
Résumé
Antimicrobial resistance is a global crisis that requires urgent attention. Although there is significant investment into drug development few of these drugs actually make it to market. There are shortcomings with some of the currently available testing methods, as these do not often take into account the in vivo environment in which the infections form. This requires a better understanding of the parameters that affect resistance and susceptibility, such as hypoxia or the recalcitrance of biofilms. Biofilms (communities of surface associated microorganisms) present a significant challenge for researchers and clinicians alike, as they are reported to be up to 1000 times more resistant to antimicrobials (Van Acker et al, 2014). These complex communities have a wealth of factors that induce increased recalcitrance to antimicrobials, and are reported to be present in up to 80% of chronic infections (Uruén et al., 2021). Yet, antimicrobial testing of biofilms is not yet widely adopted, and the use of biofilm testing in drug development is often not reported. This work aims to investigate these parameters to gain insight on how antimicrobial discovery and testing can be refined. \nThe first aim of this project was to determine the influence of culture method and hypoxia on S aureus susceptibility in several in vitro antimicrobial susceptibility testing methods. This compared broth microdilution methods (BMM), the Calgary Biofilm device (CBD), and the biofilm microtiter assay (MTA). Hypoxia was revealed to impact S aureus susceptibility in the BMM and CBD methods, and there was a large difference in the density of biofilms formed in the CBD and MTA. \nThe second aim of this project was to set up an ex vivo ovine wounded skin model infected with Staphylococcus aureus, which is simple, cost-effective, high throughput, and reproducible. The establishment of wound infection was confirmed by an increase in viable bacterial counts compared to the inoculum. This enabled the final aim to assess if the ex vivo model formed biofilms and if hypoxia would have an impact on the susceptibility of the biofilms within the ex vivo model. The presence of biofilms was confirmed through scanning electron microscopy, histology, and antimicrobial challenge of the biofilms. Hypoxia elicited an impact on the susceptibility of the ex vivo associated biofilms in an antimicrobial specific manner. \nThis work provides insight into the complex environment that is an ischemic infected wound, and has given insight into the parameters that can affect \nantimicrobial drug development in the preclinical stages.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».