Investigating strain diversity of Creutzfeldt-Jakob disease in Canada
Notice bibliographique
Résumé
Prions are infectious proteins that cause rare but invariably fatal neurodegenerative diseases in humans and other mammals. Sporadic Creutzfeldt-Jakob disease (sCJD) is the most common form of human prion disease, with an annual prevalence of 1-2 cases per million individuals. Though extremely rare, sCJD is devastating. This disease is rapid, with most patients dying within 5 months from the onset of symptoms and no available treatments. sCJD is heterogeneous, with diverse clinical signs, brain lesion profiles, and disease durations. It is believed this variability is attributed to different prion strains, which are influenced by host genetics and the shape of the misfolded protein. Strain diversity is poorly understood and remains to be explored experimentally. For these reasons, we have developed methodologies to exploit strain-specific properties and applied them in a retrospective analysis of 31 sCJD cases in Canada. We characterized the biochemical properties of the pathogenic prion proteins from these cases using thermal denaturation assays, capillary-electrophoresis immunoassays, and protein seeding kinetic assays. Atypical cases were inoculated into a novel animal model to analyze strain-specific properties such as incubation periods, clinical signs, and brain lesions. Within our cohort of 31 sCJD patients, we identified two atypical sCJD cases and two cases of a rare strain of sCJD called variably-protease sensitive prionopathy. We propose the two atypical sCJD cases represent novel strains of sCJD in Canada. Additionally, we have developed a sCJD strain baseline through which atypical cases could readily be identified in the future. Understanding prion strains has implications for the detection of zoonotic transmission as well as for the development of therapeutics.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».