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Enregistrement W7011306817

Les effets et le mécanisme d'action de l'exposition aux composés aromatiques polycycliques chez les oiseaux.

2022· other· fr· W7011306817 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueEspaceINRS Institutional Digital Repository (Institut National de la Recherche Scientifique) · 2022
Typeother
Languefr
DomaineBusiness, Management and Accounting
ThématiqueDigital Innovation in Industries
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEnvironmental factorLife historyOenococcus oeni
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Les composés aromatiques polycycliques (CAP) sont omniprésents dans l'environnement et sont souvent présents dans des mélanges complexes. Les vertébrés métabolisent et éliminent facilement les CAP, mais la métabolisation crée des effets néfastes, notamment l'embryotoxicité, la cardiotoxicité et le stress oxydatif. Dans une revue de littérature sur les CAP mesurés dans la faune canadienne, j’ai déterminé que la plupart des recherches se sont concentrées sur les mammifères et les poissons. Le développement d'outils moléculaires a été recommandé pour évaluer l'exposition et l'effet. Dans cette thèse, j’ai évalué les mécanismes d'action de l'exposition aux CAP chez les oiseaux en utilisant des outils en écotoxicogénomique. Le cormoran à aigrettes (Nannopterum auritum, précédemment Phalacrocorax auritus) est une espèce couramment utilisée dans les études de toxicité, mais peu est connu sur son transcriptome durant le développement embryonnaire. Par conséquent, j’ai utilisé une biopuce pour évaluer le transcriptome tout au long de l’incubation. Le développement du foie a marqué de nombreux changements transcriptomiques, ce qui suggère que cette étape est une fenêtre de sensibilité. Deuxièmement, pour évaluer les effets et le mécanisme d'action d'un mélange complexe de CAP, j’ai exposé trois espèces d'oiseaux (cormoran à aigrettes, fou de Bassan [Morus bassanus] et poule domestique [Gallus gallus domesticus]) in ovo à deux bitumes dilués par injection dans les chambres à air des oeufs et je les ai prélevés quand le foie s’est formé. Une analyse par qPCR ciblée a indiqué que les gènes impliqués dans le métabolisme des xénobiotiques du foie et de la membrane chorioallantoïque variaient selon les espèces aviaires, mais le biomarqueur le plus efficace était l'expression du cytochrome P450 1a (cyp1a). L'expression de gènes liés à la réponse hypoxique suggère que leur interaction avec le métabolisme des CAP pourrait faire partie du mécanisme d'action. Troisièmement, pour développer un test in vitro alternatif pour évaluer l'exposition aux CAP, j’ai exposé l’utilisation des globules rouges de poule à des concentrations de benzo[k]fluoranthène, en prélèvement des échantillons à différents moments. J’ai montré que les biomarqueurs précédemment identifiés pour l'exposition aux CAP n'étaient pas indicatifs de l'exposition dans les globules rouges, mais les données des techniques protéomiques et métabolomiques ont révélé d'autres voies essentielles affectées. Dans l’ensemble, ces résultats pourraient être utilisés pour une trousse d’outils moléculaire de biomarqueurs fiables et spécifiques à l'exposition aux CAP pour l'évaluation des risques écologiques. Polycyclic aromatic compounds (PACs) are ubiquitous in the environment and often occur in complex mixtures. Vertebrates readily metabolize and eliminate PACs, health effects such as embryotoxicity, cardiotoxicity, and oxidative stress occur in exposed wildlife. In a literature review of measured PACs in Canadian wildlife, I found that most of the studies focused on mammals and fish. The development of sensitive molecular tools for early detection of biological responses to PAC exposure was recommended. In this thesis, I evaluated the mechanisms of action of PAC exposure in birds using ecotoxicogenomics tools. First, the double-crested cormorant (Nannopterum auritum, formerly Phalacrocorax auritus) is a species commonly used in toxicity studies, but little is known about its transcriptome during normal embryonic development. Therefore, I used a custom-designed microarray to assess the transcriptome throughout incubation. The development of the liver marked many transcriptomic changes, suggesting that this stage could be a window of sensitivity for contaminant exposure. Secondly, to assess the effects and the potential mechanisms of action of a complex PAC mixture, I exposed three bird species (double-crested cormorant, Northern gannet [Morus bassanus], and domestic chicken [Gallus gallus domesticus]) in ovo to two diluted bitumens by air cell injection into the eggs, and I sampled when the liver formed. Targeted qPCR analysis indicated that genes involved in xenobiotic metabolism in the liver and chorioallantoic membrane varied among avian species but the most effective biomarker was cytochrome P450 1a (cyp1a) expression. The expression of genes in the hypoxic response pathway suggests that the interaction with PAC metabolism may be part of the mechanism of action. Thirdly, to develop a non-lethal in vitro test to assess exposure to PACs, I exposed chicken red blood cells to a geometric series of concentrations of benzo[k]fluoranthene and sampled at different timepoints. I demonstrated that PAC exposure in red blood cells did not induce biomarkers previously identified for other tissues (e.g., liver, chorioallantoic membrane), but data from proteomic and metabolomic techniques revealed other critical pathways affected by PAC exposure. Overall, these results could be used for a molecular toolkit of reliable and specific biomarkers for PAC exposure for ecological risk assessment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,116
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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