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Enregistrement W7011378116

Mouse genetic models of cardiovirulent coxsackievirus B3 infection

2014· dissertation· en· W7011378116 sur OpenAlexafffund

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2014
Typedissertation
Langueen
DomaineArts and Humanities
ThématiqueHistorical, Literary, and Cultural Studies
Établissements canadiensInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCongenicCoxsackievirusLocus (genetics)Inbred strainGeneVirusMyocarditisPhenotypeGenetic model
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Coxsackievirus B3 (CVB3) is a relatively common cause of infection. Infection by coxsackieviruses is typically mild and resolves quickly without lasting complications. In a subset of individuals, coxsackievirus infection can be severe, leading to permanent damage of vital organs or even death. The mouse presents an ideal model to study natural variation in response CVB3 infection as human isolates of CVB3 productively infect the mouse, and lead to similar pathologies as found in humans. Inbred strains of mice respond differently to CVB3 infection, therefore the genetic background of the host can determine susceptibility to CVB3 infection. We hypothesize that interrogation of genetically determined susceptibility to CVB3 infection will help to identify genes whose direct involvement in control of CVB3 was previously unsuspected. To characterize the contribution of host genetics to coxsackievirus, we screened a panel of recombinant congenic strains (RCS) generated from susceptible A/J and C57BL/6 progenitors. While most C57BL/6 background (BcA) strains were more susceptible than C57BL/6, BcA86 in particular was particularly susceptible to early lethality and hepatic necrosis. A segregating [BcA86xC57BL/10]F2 mapping cross led to the identification of a locus on distal chromosome 13 controlling liver damage during coxsackieviral hepatitis. Previously through the analysis of a segregating we detected the Vms1 (viral myocarditis susceptibility) locus on distal chromosome 3. Vms1 controls viral replication, inflammation and necrosis within the heart during CVB3 infection. We have further refined this locus in additional mapping crosses and congenic lines of mice. We have also determined that Vms1 controls viral replication before inflammation becomes evident within the heart. The cardiac specific kinase Tnni3k is a candidate gene for Vms1. We found that overexpression of TNNI3K greatly enhanced necrosis and inflammation in the heart following CVB3 infection. Furthermore, we found increased viral replication and gene expression and changes within isolated cardiomyocytes, indicating TNNI3K is implicated in a heart specific immune pathway. Altogether, our results provide new functional insight into the host determinants of pathogenesis following infection with coxsackievirus B3.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission2
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