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Enregistrement W7011403804

Malignant Pleural Mesothelioma: an investigation on relevant cancer genes and potentially repositionable drugs

2019· dissertation· en· W7011403804 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueUse Siena air (University of Siena) · 2019
Typedissertation
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueProbability and Statistical Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAsbestosMesotheliomaCarcinogenesisCancerTissue microarrayImmunohistochemistryLung cancerMesothelial CellMicroarray analysis techniques
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Malignant pleural mesothelioma (MPM) is a very aggressive cancer originating from the pleural membrane and mainly due to inhalation of asbestos. As a consequence of the past exposure to asbestos in industrialized countries and the present use in developing ones, as Canada, China, India, Kazakhstan, Russia and Thailand, the current incidence of MPM, is still high (1-6/100.000) and it is expected to further increase. The prognosis of MPM is poor with a median overall survival of less than one year from the time of diagnosis. The non-specific symptoms and the lack of accurate biomarkers do not allow a sufficiently early diagnosis for a radical treatment of the disease. To date, few pharmacological treatment options are available and effective cures are missing. Thus, the identification of novel diagnostic and prognostic biomarkers, as well as therapeutic targets is urgently needed. In the current project, we moved onto two different paths. On one side, we focused on a group of deregulated genes in MPM, as ASS1, EIF4G1, GALNT7, GLUT1, IGF2BP3, ITGA4, RAN, SLC16A1, SLC16A3, SOD1 and THBS2. In order to investigate their role in tumorigenesis of MPM we performed an RNA interference-based screen on four MPM cell lines (Mero-14, Mero-25, IST-Mes2 and NCI-H28,) and one non-malignant mesothelial cell line (MeT-5A). The screening was followed by a phenotypic study in vitro. We analysed changes in proliferation rates, caspases 3/7 activity, migration abilities and clonogenicity. In particular, for SLC16A1 and SLC16A3, we further evaluated their expression in vivo on a series of 135 MPM samples, through tissue microarray immunohistochemistry (IHC). On the other side, in the light of the lack of an efficient therapeutical treatment, we aimed to identify novel active compounds to be repositioned in the MPM therapeutic management. Thus, we screened an FDA-approved drug library on the panel of MPM and non-MPM cells above mentioned. We identified two putative drugs, as the antimetabolite Fludarabine and the bisphosphonate Risedronic Acid. Although these results are preliminary and require deepen evaluations, overall, they suggest that repurposing of these two compounds could represent a promising approach for MPM treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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