Multicenter evaluation of MIC distributions for epidemiologic cutoff value definition to detect amphotericin B, posaconazole, and itraconazole resistance among the most clinically relevant species of Mucorales
Notice bibliographique
Résumé
Clinical breakpoints (CBPs) have not been established for the Mucorales and any antifungal agent. In lieu of CBPs, epidemiologic cutoff values (ECVs) are proposed for amphotericin B, posaconazole, and itraconazole and four Mucorales species. Wildtype (WT) MIC distributions (organisms in a species-drug combination with no detectable acquired resistance mechanisms) were defined with available pooled CLSI MICs from 14 laboratories (Argentina, Australia, Canada, Europe, India, Mexico, and the United States) as follows: 10 Apophysomyces variabilis, 32 Cunninghamella bertholletiae, 136 Lichtheimia corymbifera, 10 Mucor indicus, 123 M. circinelloides, 19 M. ramosissimus, 349 Rhizopus arrhizus, 146 R. microsporus, 33 Rhizomucor pusillus, and 36 Syncephalastrum racemosum isolates. CLSI broth microdilution MICs were aggregated for the analyses. ECVs comprising ≥95% and ≥97.5% of the modeled populations were as follows: amphotericin B ECVs for L. corymbifera were 1 and 2 μg/ml, those for M. circinelloides were 1 and 2 μg/ml, those for R. arrhizus were 2 and 4 μg/ml, and those for R. microsporus were 2 and 2 μg/ml, respectively; posaconazole ECVs for L. corymbifera were 1 and 2, those for M. circinelloides were 4 and 4, those for R. arrhizus were 1 and 2, and those for R. microsporus were 1 and 2, respectively; both itraconazole ECVs for R. arrhizus were 2 μg/ ml. ECVs may aid in detecting emerging resistance or isolates with reduced susceptibility (non-WT MICs) to the agents evaluated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,017 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».