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Enregistrement W7014403557

Phages against porcine post-weaning diarrhea due to O149 Escherichia coli

2006· dissertation· en· W7014403557 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueThe Atrium (University of Guelph) · 2006
Typedissertation
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneGenomeSerotypeLysisEscherichia coliIntegraseBacteriophageEnterotoxigenic Escherichia coliLysogenic cycle
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of this study was to isolate, characterize, and evaluate phages that might be used in prevention and treatment of porcine post-weaning diarrhea due to O149 enterotoxigenic 'E. coli' (ETEC). Serotype O149:H10 was especially targeted because this is the dominant ETEC serotype and strains are highly virulent. Six phages (N1-N6) that lysed O149:H10 ETEC and three (O7-O9) that lysed O149:H43 ETEC were isolated from pig sewage from Ontario pig farms. Phages Nl-N6 lysed 99-100% of 85 O149:H10 ETEC, 0-12% of 42 O149:H43 ETEC, 3-35% of 37 non-O149 porcine ETEC, and 6-68% of the 72 strains of the ECOR collection. Phages O7-O9 lysed 86-98% of the O149:H43 ETEC, 2-53% of the O149:H10 ETEC, and 24-41% of the non-O149 porcine ETEC. The phages were susceptible to extremes of pH. All nine phages had necks and contractile tails typical of the 'Myoviridae.' The estimated genome sizes of phages Nl-N6 were 42-50 kb. Phage N1 was shown to consist of a circularly permuted genome of 52,976 bp, with terminal repeats and a G+C content of 44%. There were 75 putative genes, all reading from left to right on the same DNA strand. There was no integrase gene and no 'attp' region. The phage was unique as the genes involved in morphogenesis were related to genes of the ' Myoviridae' whereas the remaining genes were related to genes of the T7 group of phages belonging to the 'Podoviridae.' Phages N1-N6 individually and a combination of phages N1, N2, and O7 were investigated for their effectiveness as a prophylactic measure in weaned pigs that were concurrently challenged with an O149:H10 ETEC. Also, a mixture of phages N1 and N6 was evaluated as therapy after diarrhea developed following a similar experimental challenge. In both modes, individually and in combination, administration of the phages typically resulted in improvement in weight gain, and reduction in the duration and severity of diarrhea, and decreased excretion of the challenge ETEC as compared with the control pigs. These studies indicate that the N phages are good candidates for development for prophylactic and therapeutic strategies for O149:H10 ETEC diarrhea in weaned pigs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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