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Enregistrement W7014465020

Probing tissue microstructure using oscillating spin echo gradients

2018· dissertation· en· W7014465020 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueMspace (University of Manitoba) · 2018
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of ManitobaUniversity of Winnipeg
Mots-clésAxonSpin echoDiffusionMonte Carlo methodGradient echoCylinderPlanarRange (aeronautics)Measure (data warehouse)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The central nervous system (CNS) is made up of neurons and glial cells. Information is transmitted along axons to other neurons, muscles, or glands. Recent studies indicate possible changes in axon diameter distributions associated with diseases such as Alzheimer’s disease, autism, dyslexia, and schizophrenia. Magnetic resonance imaging (MRI) techniques such as diffusion MRI can be used to probe the tissue microstructure of the brain noninvasively. Current MRI axon diameter measurements rely on the pulsed gradient spin echo sequence which cannot provide short enough diffusion times to measure small axon diameters. Recent advances have allowed oscillating gradient (OG) diffusion MRI to infer the sizes of micron-scale axon diameters. Monte Carlo simulations of cosine OG sequences were conducted on a parallel cylinder (diameters 1 to 10 µm) geometry. For feasible experiments on a Bruker BG6 gradient set, the simulations inferred diameters as small as 1 µm on square packed and randomly packed cylinders. The accuracy of the inferred diameters was found to be dependent on the signal-to-noise ratio (SNR) with smaller diameters more affected by noise although all diameter distributions were distinguishable from one another for all SNRs tested. Five frequencies were adequate for d = 3 – 5 µm with single-sized cylinders and for effective mean axon diameters (AxD) greater than 2 µm for cylinders with a distributions of diameters. There was some improvement in precision for d = 1 – 2 µm with 10 frequencies. It was better to repeat measurements at higher gradient strengths than to use a range of gradient strengths. Data were collected from a portion of normal-appearing corpus callosum from an autopsy human brain, which did not demonstrate any pathological changes. The average fitted AxD was 2.0 ± 0.2 µm, while AxD obtained from electron microscopy was 1.4 ± 0.2 µm. Fitted AxD showed more variability below 7 OG frequencies and little change when using two or three gradient strengths, agreeing with the simulations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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