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Enregistrement W7014474502

Population genomics of Vaccinium vitis-idaea L. and links to environmental conditions, total phenolics, and antioxidant capacity in Newfoundland and Southern Labrador

2017· dissertation· en· W7014474502 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueMemorial University Research Repository (Memorial University) · 2017
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBerry genetics and cultivation research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEcoregionPopulationGenetic variationGenetic structureVacciniumAntioxidant capacityPopulation genomicsBiodiversityEnvironmental effect
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lingonberry, also called Partridgeberry in Newfoundland (Vaccinium vitis-idaea L.) is \nnative to Eurasia, Greenland, Iceland and North America. Partridgeberry is well known for \nits nutritional benefits, making it increasingly important for cultivation. While cultivation in \nEurope is widespread, it is only in developmental stages in North America. Knowledge of \nthe genetic structure of wild populations, and its relationship with environmental \nconditions, phenolic content (TPC), and antioxidant capacity (AC) is necessary for the \nselection of desirable genotypes, but this knowledge is incomplete globally. Therefore, the \ngenetic structure of 56 wild partridgeberry populations distributed across nine ecoregions \nof Newfoundland and Southern Labrador in Canada were investigated in the present \nexperimental study. This thesis also evaluated the effects of environmental factors on the \nTPC and AC of partridgeberry leaves. By testing different variable levels, significantly \nhigher TPC on leaves was found in individuals growing under elevated levels of surface \nwater pH (>7). Significantly higher AC was found in individuals from the Central \nNewfoundland, North Shore Forest, and Maritime Barrens ecoregions and in individuals \nwith low surface water pH (<6.6). AC was significantly lower for individuals with low \nsensitivity to acid rain (alkalinity of >200 μeq/L). Temperature and precipitation had no \neffect on TPC or AC. Contrary to expectations, no correlation between TPC and AC was \nfound. Individuals formed three genetic groups, which showed some geographic structure \naccording to ecoregion and temperature. Individuals collected in areas with the coldest \nmean annual and summer temperatures were clustered within one genetic group. As \nexpected, geographically closer individuals were also genetically closer and contained \nsimilar quantities of TPC. However, I did not find any correlation between genetic distance \nand TPC or AC, suggesting that these desired biochemical traits for plant breeding \nprograms are very much influenced by the environment. Future research should focus on \nthe environmental effects I found over a longer period of time, under controlled field or \ngreenhouse conditions, and the expression of genes in the phenyl-propanoid metabolism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,392
Score d'incertitude au seuil0,789

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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