Spatial and temporal population genetic structure of five northeastern Pacific littorinid gastropod species
Notice bibliographique
Résumé
This thesis is an investigation of the spatial and temporal population genetic structure of five northeastern Pacific littorinid gastropods that comprise three species with, and two species without a free-swimming and feeding larval phase. These 'Littorina' species share similar ecological niches and thus offer an ideal system to evaluate the effect of the presence or absence of a planktotrophic larval phase on their spatial and temporal genetic structure. Although many studies of spatial genetic structure exist, this thesis is the first to compare temporal genetic structure between direct-developing and planktotrophic marine benthic invertebrate species. The first chapter is an analysis of mitochondrial DNA variation in the planktotrophic species, ' Littorina keenae'. The analysis revealed no significant spatial population structure along approximately 2,000 km of California coastline, but two examples of a significant temporal structure between samples that were 2-3 years and 10 years apart. These data suggest that gene flow among the populations is high probably because they have a planktotrophic larval stage, while their effective population size ('Ne') is small enough to be strongly affected by genetic drift. This high level of on-going gene flow might prevent 'L. keenae' populations from becoming adapted to thermally varying local habitats. The second chapter is an ecophysiological study that found a non-linear negative relationship between thermal tolerance and degrees of latitude of the collecting sites for 'L. keenae'. The third chapter is an investigation of mitochondrial DNA variation in four ' Littorina' species using 414 bp of cytochrome 'b' gene. The analysis suggests that two planktotrophic species, 'L. scutulata ' and 'L. plena' have significantly higher levels of temporal variation, but lower levels of spatial variation in their genetic structure than does the direct-developing species, 'L. subrotundata '. To resolve the spatial and temporal genetic structure of the four species more conclusively, the fourth and final chapter extends the mitochondrial DNA data set by adding two single-copy nuclear DNA markers. Both marker sets yield similar patterns of genetic structure: the two direct-developing species have more spatial structure than the two planktotrophic species, whereas the latter species have more temporal variation in genetic structure.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».