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Enregistrement W7015348295

Studies on disease resistance based on producer-recorded data in Canadian Holstein cattle

2009· dissertation· en· W7015348295 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueThe Atrium (University of Guelph) · 2009
Typedissertation
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueAnimal Behavior and Welfare Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHeritabilityHerdSampling frameSelection (genetic algorithm)Sampling (signal processing)Dairy cattleThreshold modelGenetic correlationLinear model
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Health traits are some of the most important cost factors in dairy cattle production. Eight important health traits were chosen for data collection in Canada. They were mastitis, lameness, cystic ovarian disease, left displaced abomasum, ketosis, metritis, milk fever, and retained placenta. Data collected by producers on these 8 diseases were stored in a central database. These recordings were the basis to prepare genetic evaluations for health in Canada. Effect of the quality of the data was analyzed by using 2 different sampling frames for the inclusion of herds in the analysis: a stringent sampling frame requiring all herds to have collected at least one case of the disease analyzed and a second sampling frame requiring herds to have collected one case of any disease. Variance components were estimated with a linear model. Heritability estimates of all health traits were lower than 0.03. The second sampling frame gave lower estimates than the first one. Correlations between predicted transmitted abilities (PTA) calculated with both sampling frames were higher than 0.9. A second analysis compared the effects of using a threshold model instead of a linear model. Health traits were also grouped according to biological aspects. Heritability estimates calculated with the threshold model were higher than those of the linear model, but when they were transformed to the observable scale, results from both modelling approaches were similar. Use of indicator traits was investigated in analyzing body condition score (BCS) and health traits simultaneously. A longitudinal and a multiple-trait approach were used. BCS was positively correlated with resistance to disease, except for lameness, where a negative correlation was found. Heritability of BCS was moderate and selection for this trait would improve disease resistance. Finally, a survey was sent to producers to assess data collection practice. Most of the producers collecting health data were collecting data on mastitis. On the other hand, only 50% of producers collected data on lameness, cystic ovarian disease, ketosis or metritis. Awareness for health data collection should be raised through extension work.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,122
Score d'incertitude au seuil0,245

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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