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Enregistrement W7015378961

Some aspects of biofilm formation by enteropathogenic Escherichia coli

2013· other· en· W7015378961 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueOpenGrey (Institut de l'Information Scientifique et Technique) · 2013
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiofilmEscherichia coliEnteropathogenic Escherichia coliBacteriaMicroorganismVirulenceStrain (injury)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microorganisms growing as collective communities called 'biofilms' are widely recognised today. Biofilms impact almost all aspects of human life: personal, medical and industrial. Escherichia coli are model organisms for the study of biofi lms. In this work, eight enteropathogenic E. coli (EPEe) and three Shigella sonnei strains (a bacterium that is very similar to E. coli and is often implicated in diseases that are similar to those caused by EPEe) were investigated for their biofilm fonning abilities in relation to a number of factors. These included nutrient availabi lity, pH, temperature, time, sodium chloride concentration and iron avai lability. E. coli were able to form biofilms under all conditions tested; however, S. sonne; was not able to form any biofi lms under any of the tested settings and therefore studies on this microorganism were discontinued. The results of the investigations into biofilm-fonning abilities directed the subsequent research. These included est imation of antibiotic resistance, examination of structural development of biofilrns and the inspection of biofi lm behaviour at genetic and proteomic levels. A modification of Calgary Biofilrn Device was employed to estimate resistance to nine antibiotics in biofi lm form. A Stovall Flow Cell was employed to study the structure of biofilms formed by one (selected) strain E. coli NCiMB 555 which was transformed to express gfp in order to visualize the biotilm morphology. E. coli NelMB 555 (un-transformed) biofilms were also grown to study proteins expression and gene regulation of six targeted genes. Of these four genes were up-regulated, one was down-regulated and onc was expressed at a similar level to planktonic forms. This study contributes to the existing knowledge of the biofilm formation by E. co/; under a number of conditions, their antibiotic resistance and gene- and protein-expression associated. The findings of the work have highlighted the need for more work especially in the field of antibiotic resistance. 4

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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