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Enregistrement W7017964301

Chromofungin ameliorates colitis and reduces endoplasmic reticulum stress and P53-apoptotic pathways

2020· dissertation· en· W7017964301 sur OpenAlexaffabout

Notice bibliographique

RevueMspace (University of Manitoba) · 2020
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePolysaccharides and Plant Cell Walls
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndoplasmic reticulumUnfolded protein responseInflammationInflammatory bowel diseaseInnate immune systemApoptosisPopulationProinflammatory cytokine
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Crohn’s disease (CD) and ulcerative colitis (UC) are chronic idiopathic inflammatory bowel diseases (IBD) with an estimated prevalence in Canada of around 15/100000 persons. Biological agents are expensive, require indefinite use to ensure a sustained response, and raise concerns about infections and other complications thus limiting enthusiasm for introducing them earlier in the treatment for IBD. The essential cells in the innate immune system that coordinates the inflammatory process are the macrophages (MØ), where MØs have been demonstrated to be increased in areas of inflammation in IBD. MØs are a heterogeneous population of two different phenotypes: group 1: “inflammatory, classically activated MØs: M1” and alternative activated MØs: M2. MØs polarization and plasticity depend on specific combinations of cytokines and peptides within the microenvironment. Mucosal changes in IBD are characterized by inflammation and are linked to hyperplasia in the chromogranin-A (CHGA)-producing enterochromaffin (EC) cells. CHGA cleavages generate several biologically active peptides, including chromofungin (CHGA47-66 [CFG]). Our lab demonstrated that CFG is an essential peptide in MØs regulation. Genome-wide associated studies in IBD have revealed that in IBD and within the epithelium, endoplasmic reticulum (ER) stress and intestinal epithelial apoptosis figure strikingly. A p53-apoptotic pathway mediates intestinal epithelial apoptosis through the activation of the p53-upregulated modulator of apoptosis (PUMA), Bcl-2 associated-X protein (BAX), Bcl-2 associated death promoter (BAD), Bcl-2 antagonist/killer-1 (BAK1), Caspase-3 and Caspase-8 proteins. Polymorphisms of X-box binding protein 1 (XBP1) gene, a main UPR signalling protein (GRP78), that develop enteritis and subsequent apoptotic cell death and is associated with an increased risk of IBD, The deletion of CHGA leads to an increase in GRP78 expression in diabetes. Currently, there is a gap of knowledge in understanding the influence of CHR on macrophages, ER stress, and apoptosis markers during the development of experimental colitis. Therefore, we hypothesize that Chromofungin plays a critical role in colonic inflammation via modulating ER stress and apoptotic pathways in macrophages

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,167
Écart entre enseignants0,155 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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