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Enregistrement W7018294766

The Diagnosis of Mycobacterium avium Infections Using Serodiagnosis With Novel Lipid Antigens

2021· dissertation· en· W7018294766 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueDurham e-Theses (Durham University) · 2021
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMycobacterium research and diagnosis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHerdAntigenMycobacterium avium subspecies paratuberculosisPathogenMycobacteriumParatuberculosisEtiologySubspeciesCattle Diseases
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mycobacterium avium subspecies Paratuberculosis (MAP) is an endemic pathogen in ruminants, present in a high proportion of herds worldwide. Its presence within cattle herds creates an economic burden on both farmers and the wider economy; due to lost milk production and premature culling. \nCurrently there is a lack of sensitive and rapid detection techniques, as culture can take months to give results and traditional PCR cannot distinguish viable from non-viable cells. Tests utilising defined synthetic mycolic acids and their sugar esters have already shown promise at diagnosing tuberculosis. This will form the basis of work described here, translating those procedures to the detection of MAP using both ELISA and a flow through device. \nMAP has also been shown to survive pasteurisation, thus making it into the food chain, and has been proposed as an aetiological agent for the development of Crohn’s disease. \n•\tFirst, a study of strongly positive experimentally infected cattle samples against negative serum from a herd with no history of MAP resulted in a single antigen sensitivity/specificity of 100/100. \n•\tSecond, a study of 40 negative and 40 positive, naturally infected cattle samples from Canada resulted in a sensitivity/specificity of 85/75. Combined with the first study and utilising all 5 common antigens for diagnosis resulted in a sensitivity/specificity of 84/93 \n•\tInitial testing and translation of flow through procedures from M. tb to MAP with a pooled cattle sample resulted in defined red spots, with the control remaining clear. \n•\tMAP specific antigens tested against human Crohn’s samples as compared with healthy samples resulted in a single antigen sensitivity/specificity of 91/100 \nThis work has identified promising antigens for further large-scale testing against both MAP in cattle and Crohn’s disease. Additionally, the first test of a flow through device shows promise in developing a rapid point of care device for the detection of MAP. \n

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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