ESTABLECIMIENTO DE UN BANCO DE GERMOPLASMA DE AGAVE SPP.
Notice bibliographique
Résumé
En México, los Agaves tienen una gran importancia económica y cultural (Colunga- García, et al., 2009), además de ser plantas fundamentales en los ecosistemas áridos que habitan (Nobel,1994; García- Mendoza, 2007). El aprovechamiento de la diversidad es un factor clave para la sustentabilidad de la industria de los agaves. Actualmente se buscan distintas aplicaciones para explotar este recurso sin comprometer su perseverancia en el ambiente, sin embargo, su uso se ve condicionado por la información disponible (Colunga-García, et al., 2007), por lo que en el presente trabajo se contribuye ampliando la información de las especies involucradas, y conservándolas a largo plazo, para facilitar la accesibilidad del germoplasma vegetal a los fitomejoradores, investigadores y otros usuarios. \nEl objetivo del presente trabajo fue establecer un banco de germoplasma ex-situ e in-vitro de las especies del género Agave L. distribuidas en el Estado de México, generar un mapa de distribución del género para el Estado de México y generar la huella genética de los materiales resguardados en el banco de germoplasma, \nPara obtener el material vegetal que se establecería en el banco de germoplasma, así como la distribución del género Agave L. en el Estado de México se realizó una búsqueda en MEXU (Herbario Nacional de México) y en registros de la CONABIO (Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad). Además de 14 colectas que cubrieron 15 municipios del Estado de México, realizadas del 03/03/2015 al 14/05/2016. Los ejemplares colectados se identificaron usando los datos tomados en campo, antecedentes de las zonas y mediante el uso de las claves de Gentry (1982), e Irish e Irish (2000), una vez identificados y etiquetados se procesaron para su establecimiento en el banco de germoplasma. Con la \nIII \ninformación obtenida se elaboró el mapa de distribución mediante los programas de ArcGis 10.1 y Google earth 7.2. \nPara generar la huella genética de las 15 especies colectadas, se extrajo el ADN de un ejemplar de cada especie mediante el método CTAB (bromuro hexadeciltrimetilamonio) (Zhou et al., 1999) y se amplifico (Reacción en Cadena de la Polimerasa, PCR) usando cinco iniciadores RAPD (Los Polimorfismos de ADN Amplificados al Azar) y cinco SSR (Secuencias Simples Repetidas). \nCon los patrones de bandeo obtenidos se generaron matrices binarias, que se analizaron mediante el programa POPGENE (versión 1.32; Molecular Biology and Biotechnology Centre, University of Alberta and Center for Internacional Forestry Research, AB, Edmonton, Canadá) usando el algoritmo más elemental para la matriz de distancia o UPGMA (Unweighted Pair Group Method Arithmetic Average). La diferenciación genética se estimó a través de los valores de distancia genética, se obtuvieron los dendrogramas correspondientes para cada tipo iniciador además de uno integral que considero ambos iniciadores. \nComo resultado de las colectas se obtuvo 35 ejemplares, de 15 especies del género Agave L. así como frutos y semillas de cinco especies, en conjunto con la investigación en herbarios se consideran 17 las especies del genero Agave L. distribuidas en el Estado de México las cuales son: Agave angustifolia, A. americana, A. angustiarum, A. angustifolia, A. applanata, A. attenuata, A. dasylirioides, A. filifera, A.ghiesbreghtii, A. horrida, A. inaequidens, A. lecheguilla, A. mapisaga, A. salmiana, A. tequilana A. xylonacantha, A. Atrovirens y A. deserti (de las primeras 15 se obtuvo ejemplares durante las colectas, de las ultimas 2 no fue posible). \nLa distribución del genero Agave L. dentro del Estado de México se vio conglomerada en lo zona noreste (en la sierra de Guadalupe) y a la zona sureste. \nIV \nEl banco de germoplasma planteado se elaboró in-vitro a partir de semillas de cinco especies las cuales fueron Agave salmiana, A. horrida, A. angustifolia, A.inaequidens y A. attenuata y ex-situ a partir de las 15 especies colectadas, es decir el banco de germoplasma elaborado comprende el 88.2% de la diversidad de especies del genero Agave L. distribuidas en el Estado de México. \nComo resultado del análisis molecular se obtuvo que los iniciadores RAPD e SSR anclados, mostraron polimorfismo entre las 15 especies del género Agave L. analizadas, y permitieron la caracterización de cada una de ellas mediante su huella genética. Los dendrogramas de los iniciadores RAPD y SSR, así como del análisis integral (RAPD + SSR), mostraron grupos constantes de especies y en algunos casos fue posible relacionar genéticamente a las especies según su morfología.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».