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Enregistrement W7019065305

Elucidating the involvement of catalase in the oxidative stress-induced antibiotic susceptibility, physiology, and virulence of Acinetobacter baumannii

2024· dissertation· en· W7019065305 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueMspace (University of Manitoba) · 2024
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAcinetobacter baumanniiVirulenceCatalaseAntibioticsOxidative stressPathogenEffluxAntibiotic resistanceInnate immune systemBacteria
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acinetobacter baumannii is a Gram-negative opportunistic pathogen that has a high incidence of infection among individuals with compromised immune systems. Currently, 80% of all hospital-acquired A. baumannii infections are multidrug-resistant to at least three different families of antibiotics, including last-line treatments. Therefore, there is an urgent need for effective therapeutic strategies which requires a thorough understanding of bacterial mechanisms of resistance. Infections caused by A. baumannii are difficult to eradicate, not only due to its extensive antibiotic resistance, but also due to its ability to adapt and persist against harsh environmental and host stressors; a prominent one being oxidative stress via the generation of reactive oxygen species (e.g., H2O2). A. baumannii is known to employ protective enzymes such as catalases to degrade hydrogen peroxide to water and oxygen. Mutants with single- and double-deletions of the catalase genes katG and katE, and their respective complements, were subjected to phenotypic assays and omics analysis to help us elucidate the overall contribution of this oxidative stress response in A. baumannii. The catalase mutants exhibited reduced fitness in rich medium, which was exacerbated when supplemented with H2O2. They also displayed differential antibiotic susceptibilities that were presumed to be mediated by the resistance-nodulation-division (RND) efflux pumps. Further assessment of overall efflux activity and expression profile of the RND efflux pump-encoding genes inferred alternative antibiotic resistance mechanism(s), most likely secondary to oxidative stress. Moreover, as H2O2 is generated by the innate immune cells as a pathogen containment and clearing strategy, we were prompted to examine bacterial virulence with a macrophage survivability assay. While the absence of catalases KatG and KatE sensitized A. baumannii to oxidative stress, their involvement in the virulence of this bacterium proved to be complicated. Catalase mutants showed a surprising persistence and possibly adaptive response in phagocytic macrophages. Transcriptomic and genomic sequencing data revealed differential expression of several genes associated with information storage and processing, virulence determinants, and biomolecules transport and metabolism. Together, these observations demonstrated the complex involvement of catalases beyond their primary function of ROS detoxification. Additionally, we also created visualization tools of fluorescence plasmids to aid in the research and study of A. baumannii.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
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