FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF TWO PHENYLACETYL-COA LIGASES IN BURKHOLDERIA CENOCEPACIA
Notice bibliographique
Résumé
Burkholderia cenocepacia causes Cepacia syndrome, a fatal pneumonia that affects Cystic Fibrosis patients. Aromatic degradation has been linked to virulence in B. cenocepacia by insertional mutagenesis of genes involved in phenylacetic acid catabolism. B. cenocepacia has two paralogous copies of PaaK, the phenylacetyl-CoA ligase, which produces PA-CoA, the inducer of the pathway. Our objective was to assess a role for PaaK1 and PaaK2 in PA metabolism and virulence by constructing clean deletion mutants for each gene, and a double paaK mutant, as well as to quantify virulence using the nematode host model. Deletion and complementation of paaK1 revealed no change in killing phenotype. Reporter activity assays revealed PaaK1-dependent induction of the PA pathway 3-hydroxyphenylacetic acid but not 4-hydroxyphenylacetic acid. Altogether, these results demonstrate that 3-OHPA induces the PA degradation pathway in a paaK1 dependent manner and that PaaK1 is not involved in pathogenicity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».