Functional variations of organic cation transporters associated to inflammatory bowel disease
Notice bibliographique
Résumé
Polymorphisms in organic cation transporters SLC22A4, SLC22A23 and IBD5 locus have been associated with pathogenesis of inflammatory bowel disease (IBD). We sought to investigate the association of polymorphisms in these genes to IBD risk in a Canadian population, subclone and express human SLC22A23 gene to determine the localization in the cell. DNA samples from 160 patients with Crohn´s disease (CD), 149 patients with ulcerative colitis (UC) and 142 healthy controls were genotyped by PCR-RFLP analysis or TaqMan system. Gateway® recombination technology was used to transform and express SLC22A23 gene in HEK 293 cell line. Polymorphisms in the IBD5 locus rs17622208-AA genotype and rs11739135-CC genotype increase the risk of CD. Moreover, carriers of SLC22A23 polymorphisms rs4959235-TT genotype and rs9503518-GG genotype increase dramatically the risk of UC. We confirm that SLC22A23 polymorphisms are important in the pathogenesis of IBD and they can ultimately be used as biomarkers of the disease risk.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».