Investigation of the role of the RNA-dependant RNA polymerase in the transcription and replication of the 1918 pandemic Influenza A virus
Notice bibliographique
Résumé
The 1918 “Spanish Flu” pandemic was cause by an Influenza A virus that infected 500 million people and nearly 50 million people died. Influenza viruses utilize a RNA-Dependant RNA Polymerase (RdRp) complex, composed of the PA, PB1 and PB2 proteins along with the viral nucleoprotein (NP) to mediate viral transcription and replication. The 1918 PB1 gene has been linked to increased virulence in mice and ferrets. We have investigated the role of PB1 in the transcription and replication of the 1918 virus and its relation to pathogenicity by comparing its RdRp to the RdRp of a low virulence conventional H1N1 human virus isolate, A/Canada/RV733/2007 (RV733). Contrary to previous studies, our dual-luciferase reporter assay revealed the 1918 RdRp had lower transcriptional activity than the RV733 RdRp in vitro. The 1918 NP seems to be the key determinant for the difference in transcriptional activity of the 1918 and RV733 RdRp complexes. The 1918 PB1 in the RV733 RdRp maintained high reporter expression while the RV733 PB1 in the 1918 RdRp abolished reporter expression. 1918/RV733 chimeric PB1 proteins were also generated and evaluated with the reporter assay. Recombinant RV733/1918 viruses were generated by reverse genetics and we determined that PB1 is a key determinant of the high growth phenotype of the 1918 virus, but only a minor contributor to pathogenicity. A novel role for the 1918 NP in the high growth phenotype and pathogenicity of the 1918 virus is also described.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».