Identifying quantitative trait loci (QTL) associated with lodging resistance in Brassica napus L.
Notice bibliographique
Résumé
Brassica napus L. (canola and rapeseed) is the world’s second-largest oilseed crop, and it has significant economic importance to Canadian agriculture. However, lodging in canola is a significant agronomic issue, making maintaining high yield and oil quality in B. napus difficult. Discovering genetic regions associated with lodging resistance is essential to understand the mechanism controlling lodging. In this study, quantitative trait loci (QTL) analysis using the composite interval mapping method (ICIM) was conducted using two different doubled haploid (DH) populations. Genomic regions that govern lodging resistance, flowering date, plant height, and maturity date were successfully identified. Within the two populations (Z/B and L/R, which correspond to chapters three and four), QTLs associated with lodging explained 3.34 to 17.31 % and 5.6 to 11.52 % of phenotypic variation, respectively. QTL for lodging were identified on A01, A03, A05, A07, A10, and C01 in the Z/B population, and on A05, C02, C04, C05, and C07 in L/R population. Co-localization of QTL for lodging (LODG), day-to-flower (DTF), plant height (HT), and day-to-maturity (DTM) were found on A01 in Z/B, while no co-localization of QTL between different traits were observed in L/R. Most QTL identified for lodging were aligned with QTL for stem lignin, stem hemicellulose, branch number, sclerotinia stem rot, plant height, stem diameter, and stem breaking force in previous studies. Several of these QTL identified in this study appeared novel, which could be useful for future breeding programs to enhance lodging resistance in B. napus, resulting in improved yield and oil quality. QTL for lodging identified in the current study with phenotypic variation explained over 10 % were utilized to screen for potential candidate transcripts. Transcripts involved in plant cell wall biosynthesis/ modification, root development, cellulose activities, ethylene, auxin gibberellic acid and brassinosteroid signaling are promising candidate genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».