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Enregistrement W7019878228

Intergenomic interactions in unisexual salamanders of the genus Ambystoma (Amphibia, Caudata)

2009· dissertation· en· W7019878228 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueThe Atrium (University of Guelph) · 2009
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEvolution and Genetic Dynamics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenomeSympatric speciationLineage (genetic)Phylogenetic treeRange (aeronautics)PhylogeneticsMeiosisGenus
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

North American unisexual salamanders of the genus Ambystoma are the most ancient unisexual vertebrate lineages known to exist and demonstrate an extremely flexible and complex reproductive system. To understand how this lineage has persisted for long periods of time, three important evolutionary questions need to be answered: (1) do intergenomic exchanges take place in unisexual meiosis to generate genetic diversity; (2) is genome replacement a common reproductive mechanism in unisexual populations and; (3) is there an ancient or a particular "L" genome that has persisted in various unisexual genome compositions. In this dissertation, a combination of molecular cytogenetic techniques and phylogenetic methods were used to provide conclusive answers to these three questions. Various intergenomic exchanges and other types of chromosome mutations were identified by genomic 'in situ' hybridization (GISH) and derivative techniques in unisexual populations, suggesting that genomes of unisexual 'Ambystoma' have undergone frequent and complex reconstructions. In addition, intergenomic exchanges and major rDNA cytotypes that were generated through GISH/FISH-rDNA were used to construct a genealogy of unisexual 'Ambystoma' in southern Ontario. The results suggest that current LJJ and LJJJ unisexual populations in southern Ontario were likely derived from a few unisexual females. Finally, 283 specimens throughout the range were collected and a genealogy of the "L" genomes was constructed using a nuclear DNA marker (L-G1C12). The results demonstrate that the general geographical distribution of the haplotypes in unisexual populations conformed to those found in 'A. laterale', indicating that "L" genomes in unisexuals were obtained from sympatric or nearby populations of 'A. laterale'. The data show that replacement of genomes by sexual sperm donors frequently occurs in unisexual 'Ambystoma' across their range and there is no ancient or particular "L" genome. Complex intergenomic interactions, including intergenomic exchanges and genome replacement with sexual sperm donors, could substantially increase genetic diversity and evolutionary flexibility of unisexual 'Ambystoma'. My studies demonstrate how unisexual 'Ambystoma' can incorporate "a bit of sex" and circumvent unusual reproductive mechanisms to enable long-term evolutionary sustainability, which help us understand why sexual reproduction is common and important in animals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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