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Enregistrement W7019979762

Investigating Molluscum Contagiosum Virus Protein MC009 as a Novel Inhibitor of Human Innate Immune Signalling

2024· dissertation· en· W7019979762 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueTrinity's Access to Research Output (TARA) (Trinity College Dublin) · 2024
Typedissertation
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensTrinity College
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInnate immune systemTranscription factorImmune systemCytokineInterferon regulatory factorsInterferonEffectorInflammationSignal transductionIRF1
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Molluscum contagiosum virus (MCV) is a human-adapted poxvirus that causes mild, raised skin lesions which are highly contagious. The lesions are notable for exerting minimal to no inflammation but can persist for long durations of time without an effective anti-viral response from the host. Human innate signalling pathways are targeted by MCV encoded immunomodulators, such as MC005 and MC132. These cascades regulate two major transcription factor families responsible for driving an anti-viral immune response, the nuclear factor kappa B (NF-kB) and the interferon regulatory factor (IRF) members. These transcription factors require an importin/karyopherin shuttle to translocate into the nucleus in order to upregulate inflammatory and gene expression in response to infection. To date, less than 15 MCV proteins have been thoroughly researched and their immunomodulatory function understood. Furthermore, the role of karyopherin proteins is not well described during MCV pathogenesis and immune evasion. MC009 was previously identified as a Molluscipoxvirus specific protein by the lab, however its mechanism of action had not been defined. Pathway mapping conducted using gene reporter assays determined MC009 to be an inhibitor of pattern recognition receptor (PRR)- and cytokine-induced kB- and IRF-luciferase activity. MC009-driven inhibition resulted in reduced IL-8, IP-10 and IFN-B production and IFN-B-luciferase activity. Following this discovery, the mechanism of function was investigated. Three hypotheses were studied to understand the diminished pro-inflammatory cytokine and type I IFN production. Firstly, an MC009-p65 interaction was investigated, however, there was no indication of the two proteins directly interacting with each other. The phosphorylation of IkB was examined next which was not altered in cells expressing MC009. Lastly, transcription factor nuclear translocation was studied. MC009 detained p65 within the cytoplasm after TNFa induction, preventing p65 from translocating into the nucleus. NF-kB members depend on karyopherin proteins to transport across the nuclear membrane. Using confocal microscopy and co-immunoprecipitation (Co-IP) techniques, MC009 was observed to interact with overexpressed and endogenous karyopherin subunit a 6 (KPNA6). A strong interaction between MC009 and KPNA5 and a weaker interaction with KPNA1 were also observed. MC009 disrupts p65-mediated immune responses through KPNA function interference. Furthermore, the interaction between MC009 and KPNA6 did not inhibit KPNA6-p65 binding, but rather formed a p65-KPNA6-MC009 complex. The protein complex likely sequesters within the cytoplasm as MC009 was not observed translocating into the cell nucleus with endogenous KPNA6. In this thesis, I present MC009 as a potent inhibitor of both NF-kB and IRF3/7 signalling, a mechanism through which MCV inhibits the activation of pro-inflammatory and anti-viral immune responses. The inhibitor causes major disturbances to human immune gene regulation by p65 cytoplasmic sequestration. I report MC009 as the first MCV-derived immunosuppressor and only second known poxviral protein capable of signal inhibition by directly targeting karyopherin proteins. MC009 offers novel insights into human innate signalling whilst broadening our understanding of MCV immune evasion strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,104
Tête enseignante GPT0,403
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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