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Enregistrement W7021008501

Molecular drivers of neutrophil recruitment to primary non-small cell lung cancer

2019· dissertation· en· W7021008501 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2019
Typedissertation
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCXCL1Lung cancerKRASDownregulation and upregulationTumor microenvironmentImmune systemCell cultureSmall hairpin RNACellCXCL2
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neutrophils are associated with developing cancer lesions and are the main immune component of primary non-small cell lung cancer (NSCLC). Multiple studies support the notion that tumor associated neutrophils (TANs) can promote tumor progression. However, the exact mechanism in which these neutrophils are recruited to the tumor microenvironment remains unclear. We hypothesize that there is a hierarchy of molecular cues produced by developing lung cancers that guide circulating neutrophils to infiltrate the tumor microenvironment. Identifying these cues may permit modulation of neutrophil infiltration within developing lung cancers and act as an immunotherapeutic tool to suppress cancer progression and improve response to existing therapeutics. To this end, we profiled H-59-GFP Lewis lung carcinoma injected mice and control mice using a qRT-PCR 84 gene panel. We also profiled 3 established human primary NSCLC cell lines representing common NSCLC subtypes in patients (A549; KRAS mutant, PC9; EGFR mutant, HCC78; ROS1 translocation). We focused on 2 of the most upregulated genes across our cell lines, macrophage inhibitory factor (MIF) and C-X-C motif ligand 1 (CXCL1). Most notably, CXCL1 was upregulated 13-fold in our H-59 injected mouse versus control. After confirming protein expression of these targets by western blot and ELISA, we performed shRNA knock down (KD) of these genes and tested the migration of neutrophils towards treated and control cell lines using a novel microfluidic device. Findings from KD experiments were confirmed via antibody-mediated inhibition in the chance of non-specific KDs. We observed a 3-fold increase of neutrophil migration towards A549 cancer cell line, scramble, and empty vector controls compared to our serum free (SF) negative control (p<0.0001). This increase was inhibited in our MIF (56% decrease, p=0.0002) and CXCL1 (72% decrease, p=0.0018) KDs. Repetition with antibody-mediated inhibition yielded similar results; neutrophil migration was inhibited utilizing MIF neutralizing antibody (N.A.) (58% decrease, p=0.0122) and CXCL1 N.A. (59% decrease, p<0.0001) relative to our A549 cancer cell line. We have therefore identified 2 proteins that play a key role in neutrophil recruitment to NSCLC cell lines in vitro and have demonstrated the application of a novel microfluidic device to analyze neutrophil recruitment. Our data provides the basis for in vivo investigations to elucidate the key molecular cues for neutrophil infiltration within developing lung cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
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