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Enregistrement W7024054310

The role of TUDOR in «Drosophila» polar granule assembly and germ cell formation

2008· dissertation· en· W7024054310 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2008
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGerm plasmGerm cellSomatic cellCytoplasmGranule (geology)Germ line developmentGermline
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Germ cells are a totipotent stem cell line where meiosis occurs; without germ cell formation sexual and types of asexual reproduction cannot occur.Drosophila germ cell formation depends on a specialized cytoplasm which is at the posterior of early embryos.The germ plasm in Drosophila contains electron dense structures called polar granules.Similar electron dense structures are found in the germ line of many metazoan species.This thesis examines the polar granule component, TUDOR and its molecular function in Drosophila germ cell formation and polar granule assembly.I created a null allele of tud and found that without TUDOR, embryos are incapable of forming germ cells, while some embryos had normally patterned abdomens.As TUDOR was dispensable for somatic functions but central to germ cell formation, I isolated TUDOR containing complexes from embryos.I then compared the proteins found in my TUDOR complexes to those in VASA complexes to determine which TUDOR complex components are polar granule constituents.I examined five proteins in the TUDOR and VASA complexes, TER94, AUBERGINE, Me31B, eIF4A and Pyruvate Kinase.Reduction of VASA or TUDOR from the early embryo along with TER94, Me31B, eIF4A or AUBERGINE results in a decrease in germ cell formation.As well, TER94, Me31B, eIF4A and AUBERGINE all localize to polar granules.Three of the polar granule components we isolated, Me31B, eIF4A and AUBERGINE, are proteins typical of P bodies, sites of mRNA metabolism, suggesting that polar granules might be related to P bodies specific.Interestingly, immuno-electron micrographs of TER94, an endoplasmic reticulum (ER) component, showed that polar granules can associate with ER.We also show Pyruvate Kinase, a glycolytic protein is enriched in the germ plasm and is a polar granule component.We have developed a technique that can identify novel polar granules components missed in maternal effect screens.The proteins we have isolated and determined to be polar granule components are highly conversed, some of which have homologous proteins involved in the germline formation of species unrelated to Drosophila including mammalian species.This suggests the germline formation of widely divergent species rely on similar components and mechanisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
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