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Enregistrement W7024539609

The roles of MUSE1 and MUSE15 in plant innate immunity

2016· other· en· W7024539609 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2016
Typeother
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueTopic Modeling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaArizona Biomedical Research Commission
Mots-clésTSG101Ubiquitin-Protein LigasesIdentification (biology)Mechanism (biology)Mutation
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nucleotide-binding leucine-rich repeat (NLR) immune receptors play crucial roles in pathogen recognition and defense activation in animals and plants. The immune responses mediated by NLR proteins are tightly regulated in plants so that the host effectively responds to pathogen attack without experiencing autoimmunity. However, the mechanisms underlying this regulation are not fully understood. To better understand this process, a mutant snc1-enhancing (MUSE) forward genetic screen was performed in model plant Arabidopsis thaliana. This thesis describes the identification and characterization of two genes encoding negative regulators of defense responses, MUSE1 and MUSE15, respectively. MUSE1 encodes a previously uncharacterized RING domain protein exhibiting E3 ubiquitin ligase activity. It has a close paralog in the Arabidopsis genome, which is MUSE2. Albeit both muse1 and muse2 single mutants are wild type (WT)-like, the muse1 muse2 double knockout mutant displays severe autoimmunity, suggesting their overlapping functions in regulating defense. Through epistatic analysis, it was found that the autoimmunity of muse1 muse2 is fully dependent on SNC1, suggesting that MUSE1 and MUSE2 are specifically involved in the regulation of SNC1-mediated immunity. Genetic and biochemical analyses excluded SNC1, bHLH84 and MOS10 from being potential ubiquitination substrates of MUSE1 and MUSE2, and offered clues to the identity of the substrates of MUSE1 and MUSE2. These findings add to the growing list of characterized E3 ubiquitin ligases involved in the stringent regulation of NLR-mediated immunity. MUSE15 encodes ADR1-L1, which belongs to the ADR1 helper NLR family. Previous studies have demonstrated that the ADR1 family is required for defense mediated by multiple sensor NLRs. Unexpectedly, loss of ADR1-L1 enhances immunity-related phenotypes in multiple autoimmune mutants including snc1, cpr1, bal and lsd1. This immunity-enhancing effect is not mediated by increased SNC1 protein stability, nor is it fully dependent on the accumulation of defense hormone salicylic acid (SA). Transcriptional analysis revealed an up-regulation of ADR1 and ADR1-L2 in the adr1-L1 background, which may over-compensate the loss of ADR1-L1, leading to stronger defense responses. The complex regulation within the ADR1 family extends our knowledge on the interplay among helper NLRs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,170
Écart entre enseignants0,162 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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