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Enregistrement W7026982122

Biochemical Characterization of Flavonol Rhamnoside Catabolism in Arabidopsis thaliana and Raphanus sativus Leaves

2023· dissertation· en· W7026982122 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueThe Atrium (University of Guelph) · 2023
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePrenatal Screening and Diagnostics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaArrell Food Institute, University of GuelphCanada First Research Excellence Fund
Mots-clésRaphanusKaempferolArabidopsisCatabolismArabidopsis thalianaFructosePostharvest
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Flavonol rhamnosides such as kaempferitrin are plant secondary metabolites, whose biosynthetic mechanisms are well known. The concentrations of flavonol rhamnosides in plants decrease with abiotic stress recovery, leaf senescence, fruit maturation, and postharvest handling. Despite this, the catabolic processes promoting flavonol rhamnoside losses in plants are unknown. This thesis explores the catabolic events affecting kaempferitrin levels in the leaves of Arabidopsis thaliana L. Heynh. (Arabidopsis) and Raphanus sativus L. (radish), in response to developmental senescence and postharvest handling. Losses of several kaempferol rhamnosides including kaempferitrin were evident in the leaves of both plants. By contrast, the levels of kaempferitrin catabolites kaempferol 7-O-α-rhamnoside, kaempferol 3-O-α-rhamnoside, and kaempferol increased in these same tissues. Furthermore, evidence is provided for kaempferitrin and kaempferol-7-O-α-rhamnoside 7-O-α-rhamnosidase hydrolysis activities in leaves of both species. Kaempferitrin degradation in leaves sampled from developing Arabidopsis and postharvest radish overlapped with the marked induction in kaempferitrin 7-O-α-rhamnosidase activity, and smaller increases in the hydrolysis of kaempferol 7-O-α-rhamnoside. A flavonol 7-O-α-rhamnoside α-rhamnosidase was purified to homogeneity from postharvest stored radish leaves. Analysis of the final preparation by SDS-PAGE revealed two polypeptides of 36 kDa and 37 kDa. Moreover, size-exclusion chromatography and non-denaturing PAGE revealed the α-rhamnosidase exists as a tetramer. Mass spectrometry analysis of peptide sequences from the final enzyme preparation matched the in silico polypeptide translation of a radish fructose 1,6-bisphosphate aldolase 2 gene. The purified α-rhamnosidase had little capacity to cleave fructose 1,6-bisphosphate, a hallmark activity of fructose 1,6-bisphosphate aldolases. In vitro biochemical analyses revealed the radish enzyme is likely a glycosidase as it hydrolyzed kaempferitrin but also other rhamnosylated and glucosylated flavonols. Moreover, this hydrolysis activity was inhibited by known and hypothetical reactions products such as rhamnose, and kaempferol. On the whole, these findings indicate that the hydrolysis of 7-O-α-rhamnosylated kaempferol metabolites by a flavonol 7-O-α-rhamnoside-utilizing α-rhamnosidase is a metabolic phenomenon of the Brassicaceae plants Arabidopsis and radish.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
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