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Enregistrement W7027368740

Characterisation of Glycosylation
\nMutants in Drosophila melanogaster

2015· dissertation· en· W7027368740 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueWhite Rose eTheses Online (University of Leeds, The University of Sheffield, University of York) · 2015
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesSzegedi Tudományegyetem
Mots-clésGolgi apparatusDrosophila melanogasterGlycosylationGlycanOrganelleVesicleCogModel organism
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glycosylation is a fundamental process in cellular life, conferring structural and functional properties to proteins and lipids. In order for glycosylation to take place properly, a series of carefully regulated steps must be carried out in specific organelles of the cell. The Golgi apparatus is one of the key organelles where this post-translational modification is carefully controlled by a series of steps in a process known as vesicle trafficking. This multi-layered mechanism has many key phases by which vesicles loaded with cargo are transported from one membrane compartment to another. Glycosylation enzymes make up this cargo and the distribution of these proteins throughout the cisternal compartments of the Golgi is crucial for proper glycosylation to take place. One of the steps of vesicle trafficking is tethering, a process regulated by various proteins including the Conserved Oligomeric Golgi (COG) complex. Defects in subunits of the COG complex leads to perturbations in glycosylation which consequently can result in alterations of cellular functional homeostasis. \nIn this project we utilise Drosophila melanogaster (Dm) as a model organism to try and understand more about the role of COG in vesicle trafficking and glycosylation both in vitro and in vivo. To achieve these aims, using COG mutants, we have carried out N- and O-linked glycan profiling and flight test analysis in an effort to connect COG defects in vivo to altered glycan patterns in vitro. Also using a yeast-two-hybrid (Y2H) approach we looked at COG-Rab interactions to observe how well conserved mammalian-invertebrate trafficking interactions are. What we found are not only functional implications of COG in determining Drosophila glycan synthesis and flight ability, but also evidence of evolutionary conservation during interactions associated with membrane trafficking events.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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