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Enregistrement W7027498890

Chitosan biosynthesis and virulence in the human fungal pathogen Cryptococcus gattii [preprint]

2019· article· en· W7027498890 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueThe Journal of the American Medical Association (JAMA) Network (American Medical Association) · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCryptococcus gattiiCryptococcus neoformansCryptococcosisVirulenceImmune systemChitinPathogenic fungusPathogenCell wallBiosynthesis
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cryptococcus gattii R265 is a hyper-virulent fungal strain responsible for the major outbreak of cryptococcosis in Vancouver Island of British Columbia in 1999. It differs significantly from C. neoformans in its natural environment, its preferred site in the mammalian host, and in the nature and mode of pathogenesis. Our previous studies in C. neoformans have shown that the presence of chitosan, the deacetylated form of chitin, in the cell wall attenuates inflammatory responses in the host, while its absence induces robust immune responses, which in turn facilitate clearance of the fungus and induces a protective response. The results of the present investigation reveal that the cell wall of C. gattii R265 contains 2-3-fold higher amount of chitosan compared to that of C. neoformans. The genes responsible for the biosynthesis of chitosan are highly conserved in the R265 genome; the roles of the three chitin deacetylases (CDA) have however, been modified. To deduce their roles, single, double and a triple CDA deletion strains were constructed in a R265 background and were subjected to mammalian infection studies. Unlike C. neoformans where Cda1 has a discernible role in fungal pathogenesis, in R265 Cda3 is critical for virulence. Deletion of either CDA3 alone (cda3Δ) or in combination with either CDA1 (cda1Δ3Δ) or CDA2 (cda2Δ3Δ) or both (cda1Δ2Δ3Δ) rendered the yeast cells avirulent and were cleared from the infected host. Moreover, the cda1Δ2Δ3Δ strain of R265 induced a protective response to a subsequent infection with R265. These studies shed more light into the regulation of chitosan biosynthesis of C. gattii and its subsequent effect on fungal virulence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Expérimental (laboratoire)low
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Expérimental (laboratoire)high
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,015
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,118
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0150,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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