Community Disturbance and Host-parasite Interactions at the Wildlife-domestic Interface in a Neotropical Biodiversity Hotspot
Notice bibliographique
Résumé
Tropical ecosystems worldwide are threatened by land-use change. The resulting increased interaction between wildlife, domestic species, and humans can lead to parasite spillover and emerging diseases that can significantly impact wildlife. Measuring spillover risk presents multiple challenges, including identifying drivers of species interaction, quantifying host densities and overlap, and estimating parasite prevalence. I studied anthropogenic pressures and the associated risk of parasite spillover in the Osa peninsula, an important biodiversity hotspot in southern Costa Rica. In Chapter 1, I analyzed how anthropogenic disturbance, land protection, and habitat quality shape the vertebrate community. In collaboration with multiple institutions, I conducted a region-wide camera-trap survey and analyzed the occurrence of terrestrial mammals and ground birds using a joint species distribution model. Overall disturbance had negative impacts on occupancy of large predators and herbivores. Mesopredators like ocelots (Leopardus pardalis) were only marginally affected by disturbance and could therefore be exposed to parasites of domestic species. In Chapter 2, I used camera trap data, and estimation frameworks for marked and unmarked species, to determine ocelot density, a key determinant of epidemiological dynamics. I found important design incompatibilities between frameworks regarding camera distribution, which should be considered for density comparisons. The estimated density (34 individuals/100 km2 ) suggests a healthy population. However, ocelots frequently use trails, exposing them further to parasites of domestic species, particularly dogs. In Chapter 3, I analyzed the spillover risk of soil transmitted helminths from domestic hosts to wild felids using microscopy, molecular diagnostic, and mathematical modelling tools. I found high prevalence of hookworms (Ancylostoma caninum) in dog scats (74%). I could not identify a related parasite found in feline scat. The hookworm prevalence observed in ocelots (25%), however, was higher than the prediction from a mathematical model (5%), suggesting there is no regular transmission of helminths across species. Human encroachment on natural habitats will continue to represent a risk of emerging disease for vulnerable wildlife, domestic animals, and humans, particularly in highly biodiverse systems like the Osa. Parasite monitoring therefore must become an integral part of conservation studies at the wildlife-domestic interface. These urgent efforts will necessarily require multidisciplinary, local-based approaches.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».