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Enregistrement W7027649935

CYB5D2 IN BREAST CANCER

2021· dissertation· en· W7027649935 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueMacSphere (McMaster University) · 2021
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPTENEctopic expressionTensinCancerHEK 293 cellsIn vivoCell cultureTumor suppressor gene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Breast cancer (BC) the second leading cause of cancer death in Canadian women.1 The disease is affected by numerous genes with more to be discovered. Our lab has recently published cytochrome b5 domain containing 2 (CYB5D2) as a candidate tumor suppressor in BC.2 My research further supports this concept. In a tetracycline inducible CYB5D2 lines previously constructed in HER2+ HCC1954 BC cells, induction of CYB5D2 inhibited cell proliferation. The inhibition can be partially recovered once induction pressure was removed; recovery level was associated with the length of CYB5D2 expression with longer CYB5D2 induction accompanied with reduced recovery ability. This in vitro inhibition is supported by in vivo evidence; in xenografts formed by HCC1954 Tet-CYB5D2 cells, induction of CYB5D2 via administration of doxycycline in drinking water significantly inhibited tumor growth. To examine the potential mechanisms underpinning CYB5D2-derived inhibition, I was able to co-immunoprecipitate (Co-Ip) CYB5D2 and PTEN (phosphatase and tensin homolog) following ectopic expression of both in 293T cells, indicating the formation of the CYB5D2-PTEN complex. This possibility is further supported by co-localization of both ectopic proteins in 293T cells detected by immunofluorescence analysis. Furthermore, in HCC1954 Tet-CYB5D2 cells, a complex containing CYB5D2 and endogenous PTEN was co-immunoprecipitated following induction of CYB5D2 expression. Collectively, evidence supports an association of CYB5D2 with PTEN. I further characterized this association. Binding of PTEN with CYB5D2 was determined in 293T cells using a set of CYB5D2 mutants, including ΔCYB5, ΔTM, D86G, R7P, R7G, and Q167K. Complexes containing PTEN and individual CYB5D2 mutants could be precipitated via either CYB5D2 or PTEN, but not both. While the situation was not ideal, evidence nonetheless indicates that these structural elements of CYB52 were not essential for its association with PTEN.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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