Digestomics of Japanese abalone in real food matrix
Notice bibliographique
Résumé
Objective: Haliotis discus (Japanese abalone), mollusks among various shellfish, is a highlynutritive food resource in the world, but also among the eight allergic food groups accounting forapproximately 90% of all immunoglobulin E food allergies worldwide. The general objective of ourresearch is to comprehensively investigate stability and structures of pepsin-resistant allergens, oftheir larger fragments, and of short digestion resistant peptides (SDRPs) released by pepsindigestion of whole raw and extract of shellfish, under standardized and physiologically relevantgastric conditions.Materials and Methods: Extract of raw whole shellfish (eRSS) and whole raw shellfish (wRSS),were pepsin digested according to standardized static digestion protocol. Controls were treated in asame manner without adding pepsin. Supernatant of samples and its counterpart controls wereprecipitated with TCA/acetone. Obtained proteins were assessed by 2D SDS PAGE and 1D SDS-PAGE, under reducing and non-reducing conditions. 1D SDS-PAGE of RSS were analyzed byncLC-MS/MS (Orbitrap LTQ) shot-gun proteomics. Relative quantification was performed by LFQalgorithm within Peaks 8.5 software package Bioinformatics Solutions Inc. (BSI), Waterloo,Canada.Results and Conclusion: 1D SDS-PAGE analysis of eRSS and wRSS, and its controls showed arange of proteins in varied concentrations between 10-250 kDa. In extracted and whole rawshellfish, approximately 22 prominent protein bands were observed including the distinct bandscorresponding with the molecular weights of recognized shellfish allergen, tropomyosin (37-39kDa). Fewer high molecular weight proteins were observed followed by protein smearing,specifically around the low molecular weight protein bands. The smearing could possibly be due tothe breakdown products and the glycation. There were slight differences between the proteinprofiles under reducing and non-reducing conditions as well. Nevertheless, there was the retentionof a band in the 37kDa molecular weight marker in all 4 samples, likely consistent with heat stabletropomyosin (TM). Mass spectrometry showed allergens that are characterized (Hal d 1 and Hal di1), with 90% of sequence homology with main tropomyosin allergens from seafood.Scientific impact and relevance: The results will highlight effects of food matrix on shellfishallergens digestibility proving its relevancy in molecular allergology. Moreover, an insight will beobtained on the differences in digestibility of allergenic versus non-allergenic tropomyosins in thereal food matrix.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».