Étude de la prévalence d’infection aux parasites du genre Echinococcus chez les canidés sauvages au Québec
Notice bibliographique
Résumé
Echinococcus est un parasite zoonotique présent mondialement circulant entre les canidés et les rongeurs ou les cervidés. L’humain est un hôte accidentel et la maladie qu’il peut développer à la suite d’une infection peut entraîner de graves signes cliniques en l’absence de traitement. Dans la faune au Québec, on reconnaît E. canadensis, responsable de l’échinococcose kystique, alors qu’E. multilocularis, associé à l’échinococcose alvéolaire, n’a pas encore été détecté. Cependant, le diagnostic récent au Québec d’un cas humain d’échinococcose alvéolaire porte à croire que le parasite circule sur le territoire. Cette étude de type transversale menée dans 12 régions administratives au Québec d’octobre à mars 2020–2021 en collaboration avec des trappeurs a pour but d’estimer la prévalence du parasite chez les coyotes et les renards roux à proximité des zones habitées et de déterminer les principaux foyers d’infection. Un test RT-PCR sur contenu intestinal a été effectué sur 707 prélèvements à partir de carcasses récupérées par les trappeurs (423 coyotes et 284 renards roux). Au total, ce sont 38 échantillons qui sont revenus positifs à Echinococcus spp. (24 coyotes et 14 renards roux) et 25 à E. multilocularis (14 coyotes et 11 renards roux). Deux zones d’infection ont aussi été identifiées, soit en Montérégie et au Bas-St-Laurent, où le risque d’infection est de 5.4 à 14.4 fois plus élevé (p < 0.05). Des analyses de régression logistique n’ont pas permis de déterminer une association statistiquement significative entre le sexe, l’espèce, la localisation géographique et le statut d’infection. Les analyses effectuées ont permis de comparer les tests de diagnostic de coproscopie et RT-PCR pour Taenia spp. et l’identification des échinocoques. Cette étude a permis de démontrer la circulation du parasite sur le territoire québécois dans la majorité des régions administratives étudiées.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».